| 甘薯4-香豆酸辅酶A连接酶基因的生物信息学鉴定和表达分析 |
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| 引用本文： | 徐 靖,林延慧,王效宁,韩义胜,唐力琼,王新华,朱红林.甘薯4-香豆酸辅酶A连接酶基因的生物信息学鉴定和表达分析[J].西北植物学报,2020,40(4):581-587. |
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| 作者姓名： | 徐 靖 林延慧 王效宁 韩义胜 唐力琼 王新华 朱红林 |
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| 作者单位： | (海南省农业科学院 粮食作物研究所, 海南省农作物遗传育种重点实验室, 农业部作物基因资源与种质创制海南科学观测实验站,海口 571100) |
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| 基金项目： | 海南省科研院所技术开发专项(KYYS 2018 03) |
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| 摘 要： | 4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase, 4CL)在苯丙烷类代谢途径中具有重要调控作用。该研究利用转录组数据在甘薯品种QS48中鉴定了11个4CL基因,并将这些基因命名为Ib4CL1～Ib4CL11。序列比对和功能域分析发现, 11个Ib4CL蛋白均具有典型的4CL结构特征,包含保守的BoxⅠ和BoxⅡ的结构域。进化和保守基序分析显示,Ib4CL1和Ib4CL2属于Ⅰ类4CL,Ib4CL3属于Ⅱ类4CL,而Ib4CL4～Ib4CL11属于4CL类似蛋白。转录组数据和荧光定量PCR分析显示,Ib4CL3和Ib4CL10在甘薯QS48的叶中转录表达水平显著高于茎和块根,与绿原酸的积累呈正相关关系;Ib4CL4和Ib4CL8在嫩叶中表达较高,与花青素的积累密切相关。研究结果为进一步揭示甘薯4CL基因在苯丙烷类代谢途径中的功能奠定了基础。
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| 关 键 词： | 甘薯 4 香豆酸辅酶A连接酶(4CL) 绿原酸 花青素 表达分析 |
Bioinformatic Identification and Expression Analysis of 4CL Genes in Ipomoea batatas |
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| XU Jing,LIN Yanhui,WANG Xiaoning,HAN Yisheng,TANG Liqiong,WANG Xinhu,ZHU Honglin.Bioinformatic Identification and Expression Analysis of 4CL Genes in Ipomoea batatas[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2020,40(4):581-587. |
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| Authors: | XU Jing LIN Yanhui WANG Xiaoning HAN Yisheng TANG Liqiong WANG Xinhu ZHU Honglin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Ipomoea batatas 4 coumarate: CoA ligase (4CL) chlorogenic acid anthocyanin expression analysis |
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