| 山葡萄成熟果皮cDNA文库的构建及ESTs初步分析 |
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| 引用本文： | 李凤,杨成君,李波,王军,刘海峰.山葡萄成熟果皮cDNA文库的构建及ESTs初步分析[J].植物生理学通讯,2010(12):1232-1236. |
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| 作者姓名： | 李凤 杨成君 李波 王军 刘海峰 |
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| 作者单位： | [1]东北林业大学林学院,哈尔滨150040 [2]中国农业大学食品科学与营养工程学院葡萄与葡萄酒研究中心,北京100083 [3]延边大学农学院,吉林龙井133400 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项资金（nycytx-30） |
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| 摘 要： | 以山葡萄成熟果皮为材料,采用Creator~（TM） SMART~（TM） cDNALibraryConstruction技术构建了cDNA文库。经鉴定,文库的库容量为1.001×10~6,重组率为94.1 1%,插入片段在0.25～1.9 kb。经随机测序,获得935个有效ESTs,聚类拼接后得到636条单基因簇（unigenes）,包括107个重叠群（contigs）和529个单拷贝（singlets）。这些数据为今后山葡萄功能基因分离克隆和功能基因组学研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 山葡萄 cDNA文库 表达序列标签 |
cDNA Library Construction of Vitis amurensis Berry Skins and Primary Analysis of Expressed Sequence Tags （ESTs） |
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| LI Feng,YANG Cheng-Jun,LI Bo,WANG Jun,＊,LIU Hai-Feng.cDNA Library Construction of Vitis amurensis Berry Skins and Primary Analysis of Expressed Sequence Tags （ESTs）[J].Plant Physiology Communications,2010(12):1232-1236. |
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| Authors: | LI Feng YANG Cheng-Jun LI Bo WANG Jun ＊ LIU Hai-Feng |
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| Institution: | 1 College of Forestry,Northeast Forestry University,Harbin 150040,China;2 Center for Viticulture and Enology,College of Food Science ＆ Nutritional Engineering,China Agricultural University,Beijing 100083,China;3 School of Agricultural,Yanbian University, Longjing,Jilin 133400,China |
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| Abstract: | A cDNA library from the amur grape（Vitis amurensis Rupr.） was constructed by using Creator~（TM） SMART~（TM） cDNA Library Construction protocol.The library capacity was 1.001×10~6 with a recombinant rate of 94.11%and the inserted cDNA fragments ranged from 0.25 to 1.9 kb.935 available ESTs through random sequencing were obtained,and 636 unigenes which including 98 contigs and 201 singlets were generated after clustering.This study is propitious to gene cloning and functional genomic research of amur grape. |
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| Keywords: | amur grape（Vitis amurensis） cDNA library expressed sequence tag（EST） |
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