| 成人视网膜假定蛋白基因ARHP的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李峰,蒋卫红,尹志华,杨旭宇,冯湘玲,刘卫东,姚开泰.成人视网膜假定蛋白基因ARHP的克隆及生物信息学分析[J].生物化学与生物物理进展,2003,30(6):930-934. |
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| 作者姓名： | 李峰 蒋卫红 尹志华 杨旭宇 冯湘玲 刘卫东 姚开泰 |
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| 作者单位： | 1. 中南大学湘雅医学院肿瘤研究所,长沙,410078
2. 中南大学湘雅医院耳鼻喉科,长沙,410078 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展规划项目( 973) (G1 9980 51 2 0 0 )~~ |
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| 摘 要： | 从UniGene库中选取编号为BG2 2 2 62 4来自人鼻咽组织的表达序列标签 (EST )序列 ,联网到NCBI调用Blast服务器分析 ,发现该EST序列是一个代表新基因的未知序列 .利用Blast检索GenBank的nr数据库和EST数据库 ,构建EST重叠群 ,联网到NCBI的ORFfinder服务器 ,分析发现该EST重叠群具有完整的阅读框架 .分别在cDNA序列阅读框架的起始密码子和终止密码子的两侧设计引物 ,以人胎脑cDNA文库为模板 ,进行PCR扩增 ,测序确定该基因的cDNA全长序列 .该基因cDNA序列全长为 1672bp ,阅读框架位于第 3 0 4～ 1557位之间 ,编码由 417个氨基酸组成 ,分子质量为 46 58ku的蛋白质 ,其理论 pI为 4 2 1.将蛋白质序列通过NCBI的Blast服务器进行序列相似性分析 ,发现该基因编码的蛋白质和成年小鼠视网膜未知蛋白 (BAB3 2 2 14 )同源 .经与国际人类基因组命名委员会协商定名为成人视网膜假定蛋白 (adultretinahypotheticalprotein ,ARHP) ,GenBank登录号为AY174896.生物信息学分析表明 ,该蛋白质可能为一参与转录调控的核蛋白 .ARHP基因定位在染色体 5q3 5,跨越 3 5163bp ,含 4个外显子和 3个内含子 .在基因的 5′非翻译区有 2个CpG岛
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| 关 键 词： | 成人视网膜假定蛋白基因 基因克隆 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2003/4/15 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2003年4月15日 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of a Novel H.sapiens Adult Retina Hypothetical Protein Gene ARHP |
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| LI Feng,JIANG Wei-Hong,YIN Zhi-Hu,YANG Xu-Yu,FENG Xiang-Ling,LIU Wei-Dong and YAO Kai-Tai.Cloning and Bioinformatics Analysis of a Novel H.sapiens Adult Retina Hypothetical Protein Gene ARHP[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2003,30(6):930-934. |
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| Authors: | LI Feng JIANG Wei-Hong YIN Zhi-Hu YANG Xu-Yu FENG Xiang-Ling LIU Wei-Dong and YAO Kai-Tai |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | ARHP cloning bioinformatics analysis |
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