人类肠道病毒74型山东地方株的全基因组序列分析 |
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引用本文: | 刘晓林,陶泽新,王海岩,刘尧,宋立志,纪峰,王同展,林小娟,王素婷,徐爱强.人类肠道病毒74型山东地方株的全基因组序列分析[J].病毒学报,2013(4):398-403. |
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作者姓名: | 刘晓林 陶泽新 王海岩 刘尧 宋立志 纪峰 王同展 林小娟 王素婷 徐爱强 |
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作者单位: | 山东大学公共卫生学院;山东省疾病预防控制中心 山东省传染病预防控制重点实验室 |
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基金项目: | 山东省2012年科学技术发展计划医药卫生项目(2012YD18044);山东省医药卫生科技发展计划项目课题(2011QZ013) |
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摘 要: | 人类肠道病毒(HEV)74型是人类肠道病毒B组(HEV-B)的新成员。为了解其进化和重组特性,本研究对2005年山东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)监测系统分离到的人类肠道病毒74型山东地方株05293/SD/CHN/2005进行了全基因组序列测定和分析。与GenBank中的另2株HEV74全基因组序列比对,发现在5’NTR和3’NTR区有核苷酸缺失和插入;核苷酸序列的同源性分别为80.8%和80.6%,氨基酸同源性为96%和95.9%。山东株与原型株USA/CA75-10213间P1、P2和P3区核苷酸同源性分别为81.5%、80.0%和79.7%,氨基酸同源性分别为95.9%、96.0%和96.2%;山东株与西藏株Rikaze-136间P1、P2和P3区核苷酸同源性分别为81.9%、78.8%和79.5%,氨基酸同源性分别为95.9%、96.1%和95.7%。通过系统发生树和同源重组分析,发现该病毒可能与其他HEV-B组肠道病毒间发生重组。
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关 键 词: | 人类肠道病毒74型 基因组 重组 急性弛缓性麻痹 |
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