| 苹果PDHB-1基因家族的鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 杨菁华,高举,李文芳,刘骥,霍嘉兴,任振硕,李龙,陈佰鸿,毛娟,马宗桓.苹果PDHB-1基因家族的鉴定与表达分析[J].生物工程学报,2023,39(12):4965-4981. |
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| 作者姓名： | 杨菁华 高举 李文芳 刘骥 霍嘉兴 任振硕 李龙 陈佰鸿 毛娟 马宗桓 |
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| 作者单位： | 甘肃农业大学园艺学院, 甘肃 兰州 730070 |
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| 基金项目： | 甘肃省大学生创新创业训练计划项目(S202210733008)；甘肃省科技计划项目(21JR7RA845)；甘肃省科技重大专项(22ZD6NA045) |
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| 摘 要： | 丙酮酸脱氢酶E1组分β亚基-1 (pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta-1,PDHB-1)基因是编码丙酮酸脱氢酶复合物E1酶β亚基的基因，在果实酸度积累过程中具有重要作用。为了探究苹果(Malus domestica L.) PDHB-1家族的进化特征及其在不同酸含量苹果中的表达情况，本研究利用NCBI、Pfam等数据库和Clustal X、MEGA、TBtools等软件进行生物信息学分析，通过结合可滴定酸含量测定与实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR,q RT-PCR)分析，获得该家族基因在‘艾斯达’和‘成纪1号’2个不同酸含量的苹果中的表达情况。PDHB-1家族主要定位于叶绿体、细胞质和线粒体中，α-螺旋和不规则卷曲是该家族二级结构形成的主要因素。组织特异性表达谱显示大部分成员的表达量在果实中高于其他组织。q RT-PCR结果表明，大部分成员其表达量变化趋势与可滴定酸含量变化趋势一致，在果皮中，有14个成员的表达水平在酸含量较高的‘艾斯达’苹果中显著高于酸含量较低的‘成纪1号’，其中M...
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| 关 键 词： | 苹果 PDHB-1基因家族 生物信息学分析 实时荧光定量PCR |
| 收稿时间： | 2023/1/6 0:00:00 |
Identification and expression analysis of apple PDHB-1 gene family |
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| YANG Jinghu,GAO Ju,LI Wenfang,LIU Ji,HUO Jiaxing,REN Zhenshuo,LI Long,CHEN Baihong,MAO Juan,MA Zonghuan.Identification and expression analysis of apple PDHB-1 gene family[J].Chinese Journal of Biotechnology,2023,39(12):4965-4981. |
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| Authors: | YANG Jinghu GAO Ju LI Wenfang LIU Ji HUO Jiaxing REN Zhenshuo LI Long CHEN Baihong MAO Juan MA Zonghuan |
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| Institution: | College of Horticulture, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070, Gansu, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | apple PDHB-1 gene family bioinformatics analysis quantitative real-time PCR (qRT-PCR) |
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