| 香蕉ADA1家族成员鉴定及其在生物和非生物胁迫下的表达分析 |
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| 引用本文： | 赵琪琪,任纹慧,朱慧菲,吴秋桢,张春渝,许小琼,罗彬彬,黄玉吉,陈裕坤,林玉玲,赖钟雄.香蕉ADA1家族成员鉴定及其在生物和非生物胁迫下的表达分析[J].生物工程学报,2024,40(1):190-210. |
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| 作者姓名： | 赵琪琪 任纹慧 朱慧菲 吴秋桢 张春渝 许小琼 罗彬彬 黄玉吉 陈裕坤 林玉玲 赖钟雄 |
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| 作者单位： | 福建农林大学 园艺植物生物工程研究所, 福建 福州 350002 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划(2019YFD1000901)；国家现代农业产业技术体系(香蕉)专项资金(GARS-31-15)；福建省高原学科建设经费(102/71201801101) |
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| 摘 要： | Spt-Ada-Gcn5-乙酰转移酶(Spt-Ada-Gcn5-acetyltransferase, SAGA)是高度保守的辅助转录起始复合物，转录接头蛋白-激活的改变/缺失亚基1 (alteration/deficiency in activation 1, ADA1)，也称作组蛋白H2A功能互作因子1 (histone H2A functional interactor 1, HFI1)，它是SAGA核心模块中的一个亚基，在植物的生长发育和抗逆性方面发挥着重要的作用。为了解香蕉ADA1的分子特性，本研究基于香蕉基因组数据库，对香蕉ADA1基因家族成员进行鉴定，分析其基本理化性质、系统进化、选择压力、启动子顺式作用元件及生物与非生物胁迫下的表达等。结果显示，香蕉A、B及阿宽蕉基因组中分别有10、6、7个ADA1家族成员；成员均为不稳定的亲水性蛋白，均保守地含有SAGA-Tad1结构域，MaADA1和MbADA1均可与SAGA核心模块中的SAGA相关因子11 (SAGA-associated factor 11, Sgf11)互作；系统发育显示香蕉ADA1基因家族成员可划分为3个亚族，进化过程中大多受纯化选择；香蕉ADA1基因家族成员的基因结构差异性较大；香蕉ADA1基因家族成员含有多个响应激素的作用元件；MaADA1-1可能对香蕉在低温胁迫下的抗性起着重要的作用，MaADA1均响应香蕉枯萎病菌胁迫。本研究表明，ADA1基因家族成员在香蕉中高度保守，并可能响应生物与非生物胁迫。
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| 关 键 词： | 香蕉 Spt-Ada-Gcn5-乙酰转移酶 激活的改变/缺失亚基1 全基因组鉴定 胁迫 |
| 收稿时间： | 2023/3/14 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/6/6 0:00:00 |
Identification of banana ADA1 gene family members and their expression profiles under biotic and abiotic stresses |
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| ZHAO Qiqi,REN Wenhui,ZHU Huifei,WU Qiuzhen,ZHANG Chunyu,XU Xiaoqiong,LUO Binbin,HUANG Yuji,CHEN Yukun,LIN Yuling,LAI Zhongxiong.Identification of banana ADA1 gene family members and their expression profiles under biotic and abiotic stresses[J].Chinese Journal of Biotechnology,2024,40(1):190-210. |
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| Authors: | ZHAO Qiqi REN Wenhui ZHU Huifei WU Qiuzhen ZHANG Chunyu XU Xiaoqiong LUO Binbin HUANG Yuji CHEN Yukun LIN Yuling LAI Zhongxiong |
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| Institution: | Institute of Horticultural Plant Bioengineering, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, Fujian, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | banana Spt-Ada-Gcn5-acetyltransferase alteration/deficiency in activation 1 genome-wide identification stress |
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