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定量蛋白质组学分析链霉素耐药和敏感结核分枝杆菌临床分离株
引用本文:朱传智,赵雁林,黄香玉,逄宇,赵雅贞,庄玉辉,何秀云.定量蛋白质组学分析链霉素耐药和敏感结核分枝杆菌临床分离株[J].微生物学报,2013,53(2):154-163.
作者姓名:朱传智  赵雁林  黄香玉  逄宇  赵雅贞  庄玉辉  何秀云
作者单位:1. 解放军第三0九医院,器官移植与免疫调节北京市重点实验室,北京 100091
2. 中国疾病预防控制中心结核病预防控制中心,国家结核病参比实验室,北京102206
基金项目:国家重要传染病科技重大专项(2008ZX10003-009)
摘    要:目的]发现结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)链霉素耐药相关的潜在菌体蛋白.方法]以结核分枝杆菌临床分离链霉素敏感株01105和结核分枝杆菌H37Rv为对照,采用iTRAQ技术和生物信息学鉴定并相对定量结核分枝杆菌临床分离链霉素耐药株01108菌体蛋白,并通过WEGO功能注释聚类分析01108菌株差异表达蛋白的细胞组分、分子功能和生物进程.结果]01108菌株分别与01105菌株和H37Rv菌株比较差异表达蛋白为194个和146个,01108菌株与01105菌株和H37Rv比较均差异表达蛋白121个(共同差异表达蛋白).差异表达蛋白理论相对分子量和等电点分布广泛,其生物进程主要参与中间代谢、呼吸作用和脂质代谢,分子功能主要为催化活性功能和结合功能.共同差异表达蛋白:7个核糖体蛋白(Rv2785c,Rv0056,Rv0641,Rv0652,Rv0701,Rv1630和Rv2442c)在01108菌株中表达下调;7个蛋白在01108菌株中显著差异表达(上调大于1.20倍或下调小于0.55倍),分别为巯基过氧化物酶(Rv1932)、酰基载体蛋白脱氢酶(Rv0824c)、30S核糖体蛋白S15 (Rv2785c)、丙酮酸脱氢酶E2部分(Rv2215)、双组份转录调控蛋白(Rv3133c)以及假定未知蛋白(Rv2466c和Rv2626c).结论]iTRAQ发现了链霉素耐药结核分枝杆菌相对于链霉素敏感结核分枝杆菌和H37Rv共同差异表达蛋白,为进一步探讨结核分枝杆菌链霉素耐药机制奠定了基础.

关 键 词:结核分枝杆菌  链霉素  定量蛋白质组学  同位素标记相对和绝对定量技术
收稿时间:9/9/2012 12:00:00 AM
修稿时间:2012/11/29 0:00:00

Quantitative proteomic analysis of streptomycin resistant and sensitive clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis
Chuanzhi Zhu,Yanlin Zhao,Xiangyu Huang,Yu Pang,Yazhen Zhao,Yuhui Zhuang and Xiuyun He.Quantitative proteomic analysis of streptomycin resistant and sensitive clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis[J].Acta Microbiologica Sinica,2013,53(2):154-163.
Authors:Chuanzhi Zhu  Yanlin Zhao  Xiangyu Huang  Yu Pang  Yazhen Zhao  Yuhui Zhuang and Xiuyun He
Institution:1 Beijing Key Laboratory of Transplantation and Immune Regulation,The 309th Hospital of PLA,Beijing 100091,China 2 National Tuberculosis Reference Laboratory,National Center for Tuberculosis Control and Prevention,Chinese Center for Disease Control and Prevention,Beijing 102206,China
Abstract:
Keywords:
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