| 生物信息学分析及预测miR-17-92的分子调控网络 |
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| 引用本文： | 申健,张越,潘秋辉,孙奋勇.生物信息学分析及预测miR-17-92的分子调控网络[J].中国生物工程杂志,2012,32(3):69-75. |
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| 作者姓名： | 申健 张越 潘秋辉 孙奋勇 |
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| 作者单位： | 暨南大学生命科学技术学院 生物工程研究所 广州 510632 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(81071524) |
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| 摘 要： | miR-17-92是一个高度保守的基因家簇,参与哺乳动物多个器官发育并与多种实体瘤的发生密切相关。运用多个在线数据库,发现了miR-17-92的上游转录因子及下游靶基因间的多个前馈和反馈环路。并对参与miR-17-92调控环路的基因进行功能聚类分析,进而绘制出miR-17-92的核心调控网络图。结果提示miR-17-92与其上游转录因子共调控的靶基因可能参与了生物体的细胞周期调控,迁移、凋亡、激素应答、免疫系统发育等多种生物学过程,KEGG pathway分析提示其还与多种肿瘤信号通路密切相关。因此,对miR-17-92分子调控网络生物信息学的分析可以有助于理解其在细胞发育和肿瘤发生过程中的作用机制并为后续实验验证提供良好的指导。
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| 关 键 词： | 生物信息学分析 microRNA前馈环路 microRNA反馈环路 基因注释富集分析 |
| 收稿时间： | 2011-01-25 |
Bioinformatics Analysis and Prediction of miR-17-92 Cluster Mediated Regulatory Network |
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| SHEN Jian
,
ZHANG Yue
,
PAN Qiu-hui
,
SUN Fen-yong.Bioinformatics Analysis and Prediction of miR-17-92 Cluster Mediated Regulatory Network[J].China Biotechnology,2012,32(3):69-75. |
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| Authors: | SHEN Jian ZHANG Yue PAN Qiu-hui SUN Fen-yong |
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| Institution: | (Institute of Genetic Engineering,Jinan University,Guangzhou 510632,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Bioinformatics analysis MicroRNA feed-back loops MicroRNA feed-forward loops Gene annotation enrichment analysis |
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