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山杏苹果酸酶基因的克隆与生物信息学分析
引用本文:章文乐,蔡兼,钮俊,蒲婧懿,朱梦媛,胡惠雯,张志翔,林善枝.山杏苹果酸酶基因的克隆与生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学,2013,0(3):332-338.
作者姓名:章文乐  蔡兼  钮俊  蒲婧懿  朱梦媛  胡惠雯  张志翔  林善枝
作者单位:章文乐 (北京林业大学生物科学与技术学院,林木育种国家工程实验室,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083); 蔡兼 (北京林业大学生物科学与技术学院,林木育种国家工程实验室,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083); 钮俊 (北京林业大学生物科学与技术学院,林木育种国家工程实验室,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083); 蒲婧懿 (北京林业大学生物科学与技术学院,林木育种国家工程实验室,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083); 朱梦媛 (北京林业大学生物科学与技术学院,林木育种国家工程实验室,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083); 胡惠雯 (北京林业大学生物科学与技术学院,林木育种国家工程实验室,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083); 张志翔 (北京林业大学生物科学与技术学院,林木育种国家工程实验室,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083); 林善枝 (北京林业大学生物科学与技术学院,林木育种国家工程实验室,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083);
基金项目:国家自然科学基金项目(项目编号:J1103516)“十二五”农村领域国家科技计划课题(项目编号:2011BAD22B08)
摘    要:三羧酸转运体系(柠檬酸,苹果酸和丙酮酸)可为脂肪酸生物合成提供原料乙酰辅酶A与还原力NADPH;而苹果酸酶可催化苹果酸发生氧化脱羧而产生NADPH,是调控脂肪酸代谢的重要酶。山杏种子脂肪酸含量丰富、产油率高,是研究植物油脂代谢的良好材料。本研究以山杏为试材,采用RACE克隆和电子拼接相结合的方法,首次从山杏种子中克隆得到苹果酸酶基因(命名为SaME,GenBank上登记号为JX262381),该基因的cDNA编码区全长1923bp、编码640个氨基酸,预测其编码蛋白分子量为70.15kD、等电点为6.38;同时,运用生物信息学方法对SaME基因编码蛋白的理化特性、结构域和亚细胞定位等方面进行预测分析,结果显示,该蛋白定位在细胞的质体膜上,具有苹果酸酶活性,属于NADP-ME超家族。本文对山杏SaME基因的克隆与分析,为进一步探究苹果酸酶对油脂代谢的调控机制奠定了基础。

关 键 词:山杏  苹果酸酶  基因克隆  生物信息学分析
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