| 苹果α-法尼烯合酶基因的启动子序列及同源基因 |
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| 引用本文： | 苑克俊,刘庆忠,张力思,艾呈祥,魏海蓉,伊凯.苹果α-法尼烯合酶基因的启动子序列及同源基因[J].基因组学与应用生物学,2010,29(5). |
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| 作者姓名： | 苑克俊 刘庆忠 张力思 艾呈祥 魏海蓉 伊凯 |
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| 作者单位： | 1. 山东省果树研究所,泰安,271000
2. 辽宁省果树研究所,熊岳,115009 |
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| 基金项目： | 山东省农业科学院博士基金，教育部留学回国人员科研启动基金[2004(527)]共同资助 |
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| 摘 要： | 本文通过设计引物进行PCR扩增α-法尼烯合酶(AFS)基因的5'端区段并测序,获得510bp的‘国光’苹果AFS基因启动子和5'端非翻译区(5'UTR)序列,已在GenBank注册(登录号FJ263961)。序列分析结果表明,该序列具有典型的启动子特征,在转录起始点上游-46bp处有一个TATA盒,-93bp处有一个CAAT盒,-84bp处有一个W盒和-436bp处有一个热胁迫反应顺式作用元件GAAATTTTTT。与‘皇家嘎拉’苹果的AFS基因启动子序列(GenBank登录号AY786553.1)比对,本研究发现‘国光’苹果AFS基因启动子序列中有6个碱基(-186T,-207T,-283C,-301A,-413A和-433A)发生变异,‘皇家嘎拉’苹果AFS基因启动子序列相应位置的碱基分别为碱基缺失、-206C、-282G、-300G、-412G和-432G。重要的是,其中‘国光’苹果-413A碱基变异为G发生在一个热胁迫反应顺式作用元件GAAATTTTTT中,苹果虎皮病发生和AFS基因的转录表达是否受到这一碱基变异的影响值得进一步探讨。本研究结果还表明,在苹果AFS基因启动子和5'UTR序列中存在一个正向重复序列1(R9+IR18+R9),重复单元R9长度9bp,转录起始点位于其长度18bp的IR18区段。有趣的是,本研究新发现了一个与AFS基因启动子和5'UTR序列高度同源的450bp基因片段(GenBank注册登录号FJ469631),该同源片段缺失AFS基因中的27bp序列(R9+IR18,包含转录起始点)。据我们所知,这是果树中存在AFS基因启动子同源序列的首次报道。
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| 关 键 词： | 苹果 α-法尼烯合酶 基因组DNA 启动子 |
Promoter Sequence of alpha-Farnesene Synthase Gene in Apples and Its Homolog Gene |
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| Yuan Kejun,Liu Qingzhong,Zhang Lisi,Ai Chengxiang,Wei Hairong,Yi Kai.Promoter Sequence of alpha-Farnesene Synthase Gene in Apples and Its Homolog Gene[J].Genomics and Applied Biology,2010,29(5). |
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| Authors: | Yuan Kejun Liu Qingzhong Zhang Lisi Ai Chengxiang Wei Hairong Yi Kai |
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