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紫云英ISSR引物的筛选及PCR反应体系的优化
引用本文:孙清信,陈 坚,张 辉,祁建民,林忠平,胡鸢雷,林新坚.紫云英ISSR引物的筛选及PCR反应体系的优化[J].植物遗传资源学报,2012,13(5):870-878.
作者姓名:孙清信  陈 坚  张 辉  祁建民  林忠平  胡鸢雷  林新坚
作者单位:1. 福建省农业科学院,福州350003;福建农林大学生命科学院,福州350002;北京大学生命科学院,北京100871
2. 福建省农业科学院,福州,350003
3. 福建农林大学生命科学院,福州,350002
4. 北京大学生命科学院,北京,100871
基金项目:本研究由国家公益性行业(农业)专项(201103005);福建省省长基金项目(Sbxd0903);福建省财政专项“福建省农业科学科技创新团队建设基金”(STIF_Y01)专项经费资助。
摘    要:以紫云英为研究材料,用哥伦比亚大学(UBC)公布的100条ISSR引物和11种株系紫云英品种的DNA为模板进行PCR扩增,筛选出33条扩增条带较好的ISSR引物,对其中的ISSR引物进行梯度PCR,筛选出最佳的退火温度。再采用正交试验和单因素试验相结合的方法对紫云英ISSR-PCR反应体系的5种因素(模板、Mg2+、TaqDNA聚合酶、dNTP及引物)进行优化浓度。确立了适合紫云英的ISSR分析的反应体系。在25μl反应体系中,其反应浓度为:DNA模版50.00ng,Mg2+2.00mol/L,Taq聚合酶1.0 U,dNTP 0.25mmol/L,引物0.20μmol/L,2.5μl 10×buffer。本试验为以后利用ISSR技术进行紫云英遗传多样性分析和物种保护奠定了技术基础。

关 键 词:紫云英  退火温度  ISSR引物  正交试验  体系优化
收稿时间:2011/10/5 0:00:00
修稿时间:6/1/2012 5:10:07 PM

Optimization of ISSR's Primer and PCR Reaction System for Astragalus sinicus L.
SUN Qing-xin , Chen Jian , ZHANG Hui , QI Jian-min , LIN Zhong-ping , HU Yuan-lei , LIN Xin-jian.Optimization of ISSR's Primer and PCR Reaction System for Astragalus sinicus L.[J].Journal of Plant Genetic Resources,2012,13(5):870-878.
Authors:SUN Qing-xin  Chen Jian  ZHANG Hui  QI Jian-min  LIN Zhong-ping  HU Yuan-lei  LIN Xin-jian
Institution:1(1Fujian Academy of Agricultural Sciences,Fuzhou 350003,2College of Life Sciences,Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002,3College of Life Sciences,Peking University,Beijing 100871)
Abstract:
Keywords:Astragalus sinicus    AnneaLing temperature  primers of ISSR  Orthogonal design    system optimization
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