| 基于转录组数据的意大利蝗微卫星位点分析与分子标记开发 |
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| 引用本文： | 桑迪,徐叶,王伟亮,向敏,季荣,王晗.基于转录组数据的意大利蝗微卫星位点分析与分子标记开发[J].应用昆虫学报,2020,57(3):658-666. |
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| 作者姓名： | 桑迪 徐叶 王伟亮 向敏 季荣 王晗 |
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| 作者单位： | 中亚区域跨境有害生物联合控制国际研究中心,新疆师范大学生命科学学院,乌鲁木齐830054;新疆玛纳斯县蝗虫鼠害预测预报防治站,玛纳斯832200 |
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| 基金项目： | 新疆高校科研创新团队项目;新疆维吾尔自治区项目;新疆特殊环境物种多样性应用与调控实验室招标课题;国家重点研发计划;研究生科研创新项目 |
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| 摘 要： | 【目的】意大利蝗Calliptamus italicus (L.)是新疆荒漠半荒漠草原重要害虫。本研究利用已获得的意大利蝗转录组数据,鉴定其微卫星位点。【方法】使用MISA筛选SSR位点,利用Primer Premier 5设计引物,通过PCR扩增对引物进行验证。【结果】在意大利蝗转录组数据库中,共检测出156500个SSR位点,分布在126369条unigene中。其中,单核苷酸重复为60.88%,二核苷酸重复为23.58%,三核苷酸重复和四核苷酸重复分别为12.99%和2.04%。单核苷酸重复主要为A/T(44.38%),二核苷酸重复主要为AC/GT(12.99%)和AG/CT(8.05%)。基于筛选的SSR位点设计引物,随机挑选24对引物,对10个不同地理种群意大利蝗成虫DNA样品进行PCR扩增,共有6对引物扩增成功。【结论】本研究利用转录组数据发掘意大利蝗SSR位点,为意大利蝗分子标记、种群遗传及功能基因等研究奠定基础。
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| 关 键 词： | 意大利蝗 微卫星 转录组 分子标记 |
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