| 基于线粒体COI和16S片段序列的北部湾北部水螅水母DNA条形码分析 |
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| 引用本文： | 张珰妮,郑连明,何劲儒,张文静,林元烧,李阳.基于线粒体COI和16S片段序列的北部湾北部水螅水母DNA条形码分析[J].生物多样性,2015(1):50-60. |
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| 作者姓名： | 张珰妮 郑连明 何劲儒 张文静 林元烧 李阳 |
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| 作者单位： | 厦门大学海洋与地球学院;厦门大学海洋生物多样性与全球变化研究中心;福建省海陆界面生态环境重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年科学基金(41006078);海洋公益性行业专项(201005012-3,201005015-5);厦门大学中央高校基本科研业务费专项资金(2010121037);厦门大学海洋科学基地科研训练及科研能力提高项目(J1210050) |
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| 摘 要： | 水螅水母类是浮游动物群落的重要组成部分,在近岸海洋生态系统物质循环和能量流动中扮演着重要角色。水螅水母类形态结构简单,但其物种的准确鉴定一直是分类工作中的难点。DNA条形码极大地促进了水螅水母物种的快速、准确鉴定。本研究扩增了北部湾北部28种水螅水母的线粒体COI和16S序列,分别为92条和116条;比较了2个基因片段的种内、种间K2P(Kimura 2-parameter)遗传距离;构建了基于这2个基因片段的系统发育邻接树(neighbor-joining phylogenetic tree);并结合矢量分析构建了Klee-diagram图。结果显示:COI序列的种内遗传距离为0.008±0.005(0–0.033),种间遗传距离为0.298±0.128(0.092–0.597);16S序列的种内遗传距离为0.006±0.010(0–0.047),种间遗传距离为0.394±0.195(0.068–0.898)。2个基因序列在所调查种类中,种内遗传差异均小于种间遗传差异,存在明显的条形码间隔(barcoding gap)。基于2个基因片段的NJ树均显示,单种所有个体都位于同一独立分枝。研究结果表明,以COI和16S作为DNA条形码均能对北部湾北部常见水螅水母类进行物种鉴定。
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| 关 键 词： | DNA条形码 分子标记 矢量分析 物种鉴定 水螅水母 |
DNA barcoding of hydromedusae in northern Beibu Gulf for species identification |
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| Dangni Zhang;Lianming Zheng;Jinru He;Wenjing Zhang;Yuanshao Lin;Yang Li.DNA barcoding of hydromedusae in northern Beibu Gulf for species identification[J].Biodiversity Science,2015(1):50-60. |
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| Authors: | Dangni Zhang;Lianming Zheng;Jinru He;Wenjing Zhang;Yuanshao Lin;Yang Li |
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| Institution: | Dangni Zhang;Lianming Zheng;Jinru He;Wenjing Zhang;Yuanshao Lin;Yang Li;College of Ocean and Earth Sciences, Xiamen University;Marine Biodiversity and Global Change Research Center, Xiamen University;Fujian Provincial Key Laboratory for Coastal Ecology and Environmental Studies (CEES), Xiamen University; |
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