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瓯江2种(鱼骨)的ISSR分析优化和自然种群遗传多样性的研究
引用本文:吕耀平,胡则辉,叶丽平.瓯江2种(鱼骨)的ISSR分析优化和自然种群遗传多样性的研究[J].水生生物学报,2008,32(4):1.
作者姓名:吕耀平  胡则辉  叶丽平
作者单位:1. 丽水学院化学与生命科学学院,丽水,323000;浙江大学动物科学学院,杭州,310029
2. 浙江省海洋水产研究所,舟山,316100
3. 丽水学院化学与生命科学学院,丽水,323000
基金项目:浙江省自然科学基金,浙江省科技厅新苗人才计划项目,浙江省教育厅资助项目,浙江省丽水市科技局资助项目 
摘    要:以唇鱼骨]和花鱼骨]为材料,对影响PCR反应的主要因子-模板DNA、引物、dNTPs、Mg2+、Taq酶浓度进行优化,建立了适合唇鱼骨]和花鱼骨]基因组DNA的ISSR—PCR反应体系。25灿L的PCR反应液含有的组分和终浓度分别为:约60ng模板DNA、1.2UTaq酶、0.4μmol/L引物、2.0mmol/LMgCl,、0.2mmol/LdNTPs、2%甲酰胺。利用优化反应体系从60个ISSR引物中,筛选出18个稳定性高、重复性好的引物,对25个唇鱼骨]个体和22个花鱼骨]个体的DNA进行正式扩增,分别从两个种群分别扩增到168和156条扩增谱带,扩增片段长度在200--1500bp之间。根据扩增结果计算出两个种群的多态位点比例分别为67.52%和53.21%,Shannon多样性指数分别为0.3450和0.2749,Nei’s指数分别为0.2292和0.1837,平均有效等位基因数分别为1.3875和1.3169。两个种群内样本间的平均遗传距离分别为0.2129和0.1529,结果表明两个种群的遗传多态性较高,其中唇鱼骨]的多样性明显高于花鱼骨]群体。引物UBC845扩增的610bp带和UBC854扩增的1240bp带为唇鱼骨]种的特异性谱带。鱼骨]属鱼类基因组中均含有微卫星DNA序列:(AG)8、(GA)8、(CT)8和(GAA)8。本研究为唇鱼骨]和花鱼骨]的种质保护、合理开发利用以及选择育种提供了一些基础数据。

关 键 词:唇[鱼骨]  花[鱼骨]  ISSR  优化  遗传多样性  分子标记

OPTIMIZATION OF ISSR ANALYSIS AND STUDY ON GENETIC DIVERSITY OF TWO NATURE POPULATIONS OF HEMIBARBUS FROM OUJIANG RIVER
LU Yao-Ping,HU Ze-Hui,YE Li-Ping.OPTIMIZATION OF ISSR ANALYSIS AND STUDY ON GENETIC DIVERSITY OF TWO NATURE POPULATIONS OF HEMIBARBUS FROM OUJIANG RIVER[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2008,32(4):1.
Authors:LU Yao-Ping  HU Ze-Hui  YE Li-Ping
Abstract:
Keywords:ISSR
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