| 嗜肺军团菌SBT、PFGE、AFLP分子分型方法的比较 |
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| 引用本文： | 郭玉梅,周吉坤,张慧贤,秦丽云,赵冬,剧慧栋.嗜肺军团菌SBT、PFGE、AFLP分子分型方法的比较[J].微生物学杂志,2014(1):72-77. |
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| 作者姓名： | 郭玉梅 周吉坤 张慧贤 秦丽云 赵冬 剧慧栋 |
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| 作者单位： | 石家庄市疾病预防控制中心 微生物检验所，河北 石家庄 050011;石家庄市疾病预防控制中心 微生物检验所，河北 石家庄 050011;河北省血液中心 检验科，河北 石家庄 050011;石家庄市疾病预防控制中心 微生物检验所，河北 石家庄 050011;石家庄市疾病预防控制中心 微生物检验所，河北 石家庄 050011;石家庄市疾病预防控制中心 微生物检验所，河北 石家庄 050011 |
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| 摘 要： | 比较SBT、PFGE、AFLP三种分子分型方法在嗜肺军团菌分型研究中的分辨力,探讨SBT方法在嗜肺军团菌分型中的可应用性。收集石家庄市6所医院冷却塔水中分离的32株嗜肺军团菌,对其中的24株血清I型嗜肺军团菌进行SBT分型研究,并与PFGE和AFLP分型结果进行了比较。24株LP1型嗜肺军团菌共分为4个ST型,分辨系数为0.239 1。PFGE方法将32株菌株共分为15个PFGE型,分辨系数为0.925 4。AFLP方法将32株菌株分为23个AFLP型,分辨系数为0.973 7。通过比对EWGLI网站SBT数据库,ST1021型和ST345型为本地区独特型别且属于同一克隆系;ST1型为优势型别并在我国长期流行;由于缺失neuA而未分型的嗜肺军团菌株与其他23株菌分属于不同的克隆系。SBT方法的分型能力不及PFGE方法和AFLP方法。但SBT分型方法能够通过全球比对数据库得到更多的关于菌株遗传进化和流行分布的资料,在研究菌株分子流行病学及进化方面优于PFGE和AFLP方法。
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| 关 键 词： | 嗜肺军团菌 分子分型 SBT PFGE AFLP |
Comparison among SBT, PFGE, AFLP Molecular Typing Methods of Legionella pneumophila |
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| GUO Yu-mei,ZHOU Ji-kun,ZHANG Hui-xian,QIN Li-yun,ZHAO Dong and JU Hui-dong.Comparison among SBT, PFGE, AFLP Molecular Typing Methods of Legionella pneumophila[J].Journal of Microbiology,2014(1):72-77. |
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| Authors: | GUO Yu-mei ZHOU Ji-kun ZHANG Hui-xian QIN Li-yun ZHAO Dong and JU Hui-dong |
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| Institution: | Microbiol. Inspect. Inst., Ctr. for Dis. Ctl. & Prevent. Shijiazhuang city, Shijiazhuang 050011;Microbiol. Inspect. Inst., Ctr. for Dis. Ctl. & Prevent. Shijiazhuang city, Shijiazhuang 050011;Blood center of Hebei Province;Microbiol. Inspect. Inst., Ctr. for Dis. Ctl. & Prevent. Shijiazhuang city, Shijiazhuang 050011;Microbiol. Inspect. Inst., Ctr. for Dis. Ctl. & Prevent. Shijiazhuang city, Shijiazhuang 050011;Microbiol. Inspect. Inst., Ctr. for Dis. Ctl. & Prevent. Shijiazhuang city, Shijiazhuang 050011 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Legionella pneumophila molecular typing sequence based typing (SBT) pulsed field gel electrophoresis (PFGE) amplified fragment length polymorphism (AFLP) |
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