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与泛肽途径可能相关的新基因UBAP1的克隆和表达分析
引用本文:钱骏,张小慧,等.与泛肽途径可能相关的新基因UBAP1的克隆和表达分析[J].生物化学与生物物理学报,2001,33(2):147-152.
作者姓名:钱骏  张小慧
基金项目:国家863高科技项目资助!(批准号 :10 2 10 0 1 0 5,Z19 0 1 0 1 0 3),国家重点基础研究发展规划 (973)项目资助!(批准号 :G19980 5100
摘    要:在先前确定了鼻咽癌9p21-22区域的一个最小共同缺失区内的基础上,为了筛选和克隆鼻咽癌相关的修选抑瘤基因,应用EST介导的定位候选克隆策略,用RT-PCR及Northern杂交检测了22个表达序列标签(expressed sequence tag,EST)在鼻咽癌细胞株HNE-1和原代培养的正常鼻咽上皮细胞中的表达水平,发现其中一个EST w56112在鼻咽癌细胞株HNE-1中的表达显著下调,RNA印迹显示其代表一转录本为2.7kb的基因。进一步运用cDNA测序和RACE方法克隆了该EST代表的基因全长cDNA,Genbank登录呈AF222043,同时结合生物信息学方法克了该基因在小鼠中的同源基因,Genbank登录AF275549。该基因cDNA全长2.7kb,编码由502个氨基酸组成的、分子质量为55kD的蛋白质。数据库分析显示该基因编码的蛋白质羧基段含有两个重要的泛肽相关结构域(UBA domain),属于泛肽相关蛋白家族的一个新成员,因此征得国际人类基因组命名委员会同意,将其命名为UBAP1基因。运用Northern杂交和 RT-PCR方法检测发现UBAP1基因在所检测的人和小鼠的组织中广泛表达。采用RT-PCR和直接测序的方法,未能发现UBAP1基因编码区在鼻咽癌细胞株HNE-1和10例鼻咽癌活检标本中存在突变。UBAP1基因作为一个泛肽相关蛋白家族的新成员,有可能参与泛肽信号途径;结合其在9p的定位信息及在鼻咽癌中的表达下调。有等对UBAP1基因进行为精细的突变分析,以进一步研究其表达下调参与鼻咽癌发生发展的可能机制。

关 键 词:鼻咽肿瘤  基因表达  基因克隆  染色体9p  UBAdomain  UBAP1基因  泛肽途径

Cloning and Expression Analysis of a Novel Gene, UBAP1, Possibly Involved in Ubiquitin Pathway
Abstract:
Keywords:nasopharyngeal neoplasms  gene expression  gene cloning  chromosome 9p  UBA domain  
本文献已被 维普 等数据库收录!
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