| 奶牛CRP基因SNP的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 夏志,刘小林,郭家中,徐阿娟.奶牛CRP基因SNP的生物信息学分析[J].生物信息学,2011,9(1):10-15. |
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| 作者姓名： | 夏志 刘小林 郭家中 徐阿娟 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学动物科技学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,杨凌,712100 |
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| 基金项目： | 国家十一五“863”面上项目(2008AA10Z144); “十一五”国家科技支撑计划的项目(2006BAD04A11); 陕西省“13115”科技创新工程项目(2008ZDKG-11); 西安市科技计划项目(NC09049-2) |
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| 摘 要： | 利用PCR-SSCP方法检测了CRP基因在中国荷斯坦奶牛群体中的单核苷酸多态性,并用各种网络分析软件分析了单核苷酸改变对其功能的影响。结果表明:CRP基因在P1引物扩增片段中存在PCR-SSCP多态性并引起编码氨基酸的改变。经测序分析可知,位于P1引物扩增片段内存在G→T突变,该突变位点使编码的氨基酸发生Q→H的改变。对引起编码氨基酸的P1位点进一步进行生物信息学分析发现,由于编码的改变引起新的转录结合们点vaccinia-term-s的产生,但没有引起其它CRP二三级结构的变化。这一分析结果可为奶牛CRP基因突变所产生的性状功能的改变提供分子水平的解释。
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| 关 键 词： | C反应蛋白基因 单核苷酸多态 奶牛 SSCP |
Bioinformatic analysis of dairy CRP gene SNP |
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| XIA Zhi,LIU Xiao-lin,GUO Jia-zhong,XU A-juan.Bioinformatic analysis of dairy CRP gene SNP[J].China Journal of Bioinformation,2011,9(1):10-15. |
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| Authors: | XIA Zhi LIU Xiao-lin GUO Jia-zhong XU A-juan |
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| Institution: | XIA Zhi,LIU Xiao-lin,GUO Jia-zhong,XU A-juan (Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture,College of Animal Science and Technology,Northwest A & F University,Yangling 712100,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | C-reactive protein gene SNP dairy SSCP |
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