| Chlorella sorokiniana rbcL基因的克隆与序列分析及其与18S rRNA基因在分类学上的比较 |
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| 引用本文： | 夏金兰,刘鹏,万民熙,王润民,李丽,邱冠周.Chlorella sorokiniana rbcL基因的克隆与序列分析及其与18S rRNA基因在分类学上的比较[J].现代生物医学进展,2010,10(24). |
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| 作者姓名： | 夏金兰 刘鹏 万民熙 王润民 李丽 邱冠周 |
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| 作者单位： | 中南大学资源加工与生物工程学院,湖南,长沙,410083;生物冶金教育部重点实验室,湖南,长沙,410083 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金创新研究群体科学基金资助项目(50621063) |
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| 摘 要： | Rubisco大亚基基因(rbcL)广泛用于系统学分析中,在本文中以Chlorella sorokiniana CS-01叶绿体基因组DNA为模板,PCR扩增rbcL全长编码区序列,序列分析表明:该片段全长1428 bp,其中包括1425 bp的编码区序列,编码475个氨基酸,经BLAST比对发现同源性最高的为Chlorella sp.IFRPD 1018,同源性达到99.2%。同时构建系统发育树,结果显示Chlorellasorokiniana CS-01与Chlorella sp.IFRPD 1018在同一分支中。18S rDNA序列分析表明:该片段全长1740 bp,经BLAST比对发现同源性最高的为Chlorella sorokiniana,同源性达到99.7%,构建系统发育树显示Chlorella sorokiniana CS-01与两株Chlorellasorokiniana在同一分支中,支持率达到100%。但是18S rDNA序列构建的系统发育树鉴定的主要分支很少,即使鉴定出分支,该分支的支持率也比较弱,而rbcL基因序列构建的系统发育树则分支清晰且支持率较高。可见18S rDNA序列比rbcL...
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| 关 键 词： | 小球藻 rbcL 克隆 序列分析 |
Cloning and Sequence Analysis of rbcL Gene from Chlorella Sorokiniana and Comparison with 18S rDNA Gene in Taxonomy |
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| XIA Jin-lan,LIU Peng,WAN Min-xi,WANG Run-min,LI Li,QIU Guan-zhou.Cloning and Sequence Analysis of rbcL Gene from Chlorella Sorokiniana and Comparison with 18S rDNA Gene in Taxonomy[J].Progress in Modern Biomedicine,2010,10(24). |
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| Authors: | XIA Jin-lan LIU Peng WAN Min-xi WANG Run-min LI Li QIU Guan-zhou |
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| Institution: | XIA Jin-lan1,2,LIU Peng1,WAN Min-xi1,WANG Run-min1,LI Li1,QIU Guan-zhou1,2(1 School of Minerals Processing and Bioengineering,Changsha,Hunan 410083,China 2 Key Laboratory of Ministry of Education of Biological Metallurgy,Changsha 410083,Hunan,China) |
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| Abstract: | In this paper,the ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene rbcL was cloned and analyzed from Chlorella sorokiniana CS-01 chloroplast genome.Sequencing analysis indicated that this fragment was 1428 bp in size.The com-plete open reading frame of Chlorella sorokiniana CS-01 rbcL gene is 1425bp encoding a polypeptide of 475 amino acids.The BLAST result shows that Chlorella sorokiniana CS-01 has the highest homologies with Chlorella sp.IFRPD 1018 with 99.2% sequence similarity.The BLAS... |
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| Keywords: | Chlorella sorokiniana rbcL gene cloning sequence analyses |
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