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苹果Ty1-copia类逆转座子家族鉴定及特性分析
引用本文:孙俊,房经贵,孙其宝,章镇.苹果Ty1-copia类逆转座子家族鉴定及特性分析[J].西北植物学报,2009,29(12).
作者姓名:孙俊  房经贵  孙其宝  章镇
作者单位:1. 南京农业大学,园艺学院,南京,210095;安徽农业大学,园艺学院,合肥,230036
2. 南京农业大学,园艺学院,南京,210095
3. 安徽省农业科学院,园艺研究所,合肥,230031
基金项目:国家自然科学基金项目,安徽农业大学稳定与引进人才科研启动专项基金项目 
摘    要:根据逆转座子RT保守序列设计引物,利用PCR方法从苹果'嘎拉'中克隆了20条RT片段,分析苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子家族特性及进化关系.结果显示,20条逆转录酶保守序列表现出了高度的异质性.结合已报道的37条苹果Ty1-copia类逆转座子RT片段,构建了系统发育树,发现家族1、3和4中具有转座活性的逆转座子的可能性较大;序列分析表明,Ty1-copia类逆转座子是苹果基因组内序列重组的热点.用RT序列为探针进行Southern杂交,发现苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子拷贝数高、分布广泛.研究结果为进一步分离具有转座活性的苹果Ty1-copia类逆转座子及其人工诱导芽变奠定了基础.

关 键 词:苹果  Ty1-copia类逆转座子  逆转录酶  进化

Identification and Characteristics of Apple Ty1-copia-like Retrotransposons
SUN Jun,FANG Jing-gui,SUN Qi-bao,ZHANG Zhen.Identification and Characteristics of Apple Ty1-copia-like Retrotransposons[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2009,29(12).
Authors:SUN Jun  FANG Jing-gui  SUN Qi-bao  ZHANG Zhen
Institution:SUN Jun1,2,FANG Jing-gui1,SUN Qi-bao3,ZHANG Zhen1(1 Horticulture Department,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China,2 Horticulture Department,Anhui Agricultural University,Hefei 230036,3 Horticulture Research Institute,Anhui Academy of Agriculture Science,Hefei 230031,China)
Abstract:
Keywords:
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