| 2008～2010年河南省人肠道病毒71型基因特征和重组分析 |
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| 引用本文： | 卫海燕,许玉玲,黄学勇,马宏,陈豪敏,许汴利.2008～2010年河南省人肠道病毒71型基因特征和重组分析[J].病毒学报,2011,27(5):433-437. |
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| 作者姓名： | 卫海燕 许玉玲 黄学勇 马宏 陈豪敏 许汴利 |
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| 作者单位： | 河南省疾病预防控制中心,郑州,450016;河南省疾病预防控制中心,郑州,450016;河南省疾病预防控制中心,郑州,450016;河南省疾病预防控制中心,郑州,450016;河南省疾病预防控制中心,郑州,450016;河南省疾病预防控制中心,郑州,450016 |
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| 基金项目： | 河南省医学科技重大攻关项目(201001015) |
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| 摘 要： | 对河南省2008～2010年河南省人肠道病毒71型进行基因特征及重组特点研究。对河南省2008～2010年分离的5株肠道病毒EV71型构建VP1序列系统进化树并分析其全基因组序列的重组特点。VP1序列系统进化分析显示2008～2010年河南株均属于C4基因型的C4a亚群,Bootscan分析和5’NCR、P1、P2、P3区的进化树证实C4基因型在2A～2B处存在EV71的B基因型和C基因型的型内重组及在3B～3C处存在EV71的B基因型和CA16/G-10间的型间重组。2008～2010年河南EV71分离株为C4基因型的C4a亚群,与2004年以来的中国大陆优势株流行趋势完全一致,EV71C4基因型存在基因型内和型间双重组现象。
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| 关 键 词： | 肠道病毒 EV71 系统进化分析 重组 |
Genomic characteristics and recombination of enterovirus 71 strains isolated in Henan Province between 2008 and 2010 |
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| Wei Hai-Yan,Xu Yu-Ling,Huang Xue-Yong,Ma Hong,Chen Hao-Min,Xu Bian-Li.Genomic characteristics and recombination of enterovirus 71 strains isolated in Henan Province between 2008 and 2010[J].Chinese Journal of Virology,2011,27(5):433-437. |
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| Authors: | Wei Hai-Yan Xu Yu-Ling Huang Xue-Yong Ma Hong Chen Hao-Min Xu Bian-Li |
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| Institution: | WEI Hai-yan,XU Yu-Ling,HUANG Xue-yong,MA Hong,CHEN Hao-min,XU Bian-li (Henan Center for Disease Prevention and Control,Zhengzhou 450016,China) |
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| Abstract: | To reveal the genetic features and recombination of enterovirus 71 isolates between 2008 and 2010.A total of 5 enterovirus 71 isolates were sequenced completely and phylogenetic analysis and recombination were performed.Phylogenetic analysis based on VP1 regions revealed that the Henan enterovirus 71 between 2008 and 2010 belonged to C4a in subgenotype C4.Bootscan analyses and phylogenetic analysis based on the 5'UTR,P1,P2,P3 genomic regions revealed the recombinations between EV71 genotypes B and C at the ... |
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| Keywords: | Enterovirus EV71 Phylogenetic analysis recombination |
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