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基于高通量测序技术研究色胺酮对溃疡性结肠炎小鼠肠道菌群的影响
引用本文:梁艳妮,唐志书,李璐含,乔帆帆,武伟伟,吴柯楠,王征.基于高通量测序技术研究色胺酮对溃疡性结肠炎小鼠肠道菌群的影响[J].中国微生态学杂志,2021,33(4):380-387, 393.
作者姓名:梁艳妮  唐志书  李璐含  乔帆帆  武伟伟  吴柯楠  王征
作者单位:陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/ 秦药特色资源研究开发国家重点实验室培育/ 陕西省创新药物研究中心,陕西中医药大学,陕西 咸阳 712083
基金项目:国家自然科学基金(81803951,81973687);陕西省科技厅项目(2018SF 193);陕西省教育厅项目(20JY012);2019年度陕西高校青年创新团队(陕教[2019]90号);陕西高校第三批“青年杰出人才支持计划”(陕教工[2019]95号);陕西省首批中医药优秀中青年科技骨干人才支持计划
摘    要:目的研究色胺酮对葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导溃疡性结肠炎(UC)模型小鼠肠道菌群的影响。方法用3%DSS自由饮用7 d诱导昆明种小鼠UC模型,灌胃125 mg/kg柳氮磺胺吡啶作为阳性对照,色胺酮组以78 mg/kg水溶液灌胃给药,观察小鼠给药前后的体征,进行疾病活动指数(DAI)评分,观察结肠组织形态变化;ELISA法检测小鼠血清中IL-6、IL-8、IL-10、IL-1β和TNF-α水平变化;每组收集5个粪便样本,利用Illumina MiSeq测序平台采用细菌的16S rRNA进行V4-V5区高通量测序,对测序结果进行生物信息学分析。结果色胺酮和阳性药干预后,DAI评分表明小鼠体征有所改善,HE染色显示UC小鼠结肠组织损伤有一定程度修复,炎性细胞减少;ELISA检测显示小鼠血清中促炎性细胞因子IL-6、IL-8、IL-1β和TNF-α水平下调,抑炎性细胞因子IL-10水平上升;测序后菌群物种注释及生物多样性分析显示色胺酮干预后UC小鼠失调的厚壁菌门/拟杆菌门比例得到一定程度恢复,菌群多样性有一定程度回调,菌群结构向正常状态恢复;肠道菌群LEfSe组间差异显著性分析结果表明4个菌属Erysipelotrichaceae_UCG_003、Sellimonas、Rikenellaceae_RC9_gut_group和Tyzzerella丰度可能与色胺酮对UC治疗作用相关。结论色胺酮治疗UC小鼠后,小鼠体征、结肠组织病理结构、细胞因子水平及肠道菌群变化等结果均表明色胺酮对UC小鼠肠道微生态具有调节作用,为色胺酮抗UC作用机制研究提供了新思路。

关 键 词:色胺酮  溃疡性结肠炎  16S  rRNA基因测序  肠道菌群  多样性分析

Effect of tryptanthrin on intestinal flora in mice with ulcerative colitis based on high throughput sequencing
LIANG Yan ni,TANG Zhi shu,LI Lu han,QIAO Fan fan,WU Wei wei,WU Ke nan,WANG Zheng.Effect of tryptanthrin on intestinal flora in mice with ulcerative colitis based on high throughput sequencing[J].Chinese Journal of Microecology,2021,33(4):380-387, 393.
Authors:LIANG Yan ni  TANG Zhi shu  LI Lu han  QIAO Fan fan  WU Wei wei  WU Ke nan  WANG Zheng
Institution:Co construction Collaborative Innovation Center for Chinese Medicine Resources Industrialization by Shaanxi & Education Ministry / State Key Laboratory of Research & Development of Characteristic Qin Medicine Resources Cultivation/ Shaanxi Innovative Drug Research Center, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xianyang, Shaanxi 712083, China
Abstract:
Keywords:
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