| 奶牛产奶性状与乳房炎相关基因CpG含量及分布特征的比较分析 |
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| 引用本文： | 解小莉,俞英,袁志发,杨洁,马裴裴,李迪超,尉守科,安峰,封晓静,张沅.奶牛产奶性状与乳房炎相关基因CpG含量及分布特征的比较分析[J].遗传,2012,34(4):59-66. |
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| 作者姓名： | 解小莉 俞英 袁志发 杨洁 马裴裴 李迪超 尉守科 安峰 封晓静 张沅 |
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| 作者单位： | 解小莉 (西北农林科技大学理学院,杨凌,712100) ； 俞英 (中国农业大学动物科技学院,北京,100193) ； 袁志发 (西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100) ； 杨洁 (中国农业大学动物科技学院,北京,100193) ； 马裴裴 (西北农林科技大学理学院,杨凌,712100) ； 李迪超 (中国农业大学动物科技学院,北京,100193) ； 尉守科 (中国农业大学动物科技学院,北京,100193) ； 安峰 (西北农林科技大学理学院,杨凌,712100) ； 封晓静 (西北农林科技大学理学院,杨凌,712100) ； 张沅 (西北农林科技大学理学院,杨凌,712100) ； |
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| 基金项目： | 教育部基本科研项目,国家奶牛产业技术体系专项资金,西北农林科技大学08,回国人员科研启动基金,"863"重大项目牛全基因组SNP芯片的检测与分析,"十二五"农村领域国家科技计划课题,国际合作项目( |
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| 摘 要： | DNA甲基化是表观遗传学的重要组成部分,基因启动子区及第一外显子区的CpG甲基化通常抑制该基因的表达,而去甲基化则促进基因表达。已有的研究发现荷斯坦牛的乳房炎指标SCC(Somatic cell count)与产奶量呈较强负相关。文章分析并比较了这两类性状的相关基因的启动子区、第一外显子、下游2 000 bp序列中CpG含量及分布特征。结果表明,乳房炎相关基因的启动子、第一外显子中CpG含量显著低于产奶性状相关基因,而两类性状基因下游2 000 bp序列中CpG含量无显著性差异。另外,文中提出了两个量化基因序列中CpG特征的指标,一个是CpG平均距离,用来衡量序列中的CpG分布;另一个是条件概率p(G|C),用以量化序列中二核苷酸CpG随碱基C出现的可能性,并对两类基因的启动子和第一外显子区域的这两个指标做了统计检验。研究结果对产奶性状与乳房炎相关基因的DNA甲基化调控研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 产奶性状相关基因 乳房炎相关基因 CpG座位 DNA甲基化 条件概率 |
Comparative analysis on content and distribution of CpG sites in milk production traits and mastitis-related genes in dairy cattle |
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| XIE Xiao-Li,YU Ying,YUAN Zhi-Fa,YANG Jie,MA Pei-Pei,LI Di-Chao,YU Shou-Ke,AN Feng,FENG Xiao-Jing,ZHANG Yuan.Comparative analysis on content and distribution of CpG sites in milk production traits and mastitis-related genes in dairy cattle[J].Hereditas,2012,34(4):59-66. |
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| Authors: | XIE Xiao-Li YU Ying YUAN Zhi-Fa YANG Jie MA Pei-Pei LI Di-Chao YU Shou-Ke AN Feng FENG Xiao-Jing ZHANG Yuan |
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| Institution: | 1.College of Sciences,Northwest A&F University,Yangling 712100,China;2.College of Animal Science & Technology,China Agricultural University,Beijing 100193,China;3.College of Animal Science and Technology,Northwest A&F University,Yangling 712100,China;4.College of Information Engineering,Northwest A&F University,Yangling 712100,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | milk production traits-associated genes mastitis-related genes CpG site DNA methylation conditional probability |
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