|
|||||
|
|
| 凋亡相关基因的整合分析及基因表达芯片的制备 | |
| 引用本文： | 黄茉莉,孙道春,娄雅欣,尹燕斌,李川昀,张 勇,高 歌,王升启,伯晓晨,魏丽萍,李松岗.凋亡相关基因的整合分析及基因表达芯片的制备[J].生物化学与生物物理进展,2008,35(12):1451-1460. |
| 作者姓名： | 黄茉莉 孙道春 娄雅欣 尹燕斌 李川昀 张 勇 高 歌 王升启 伯晓晨 魏丽萍 李松岗 |
| 作者单位： | 1. 北京大学生物信息中心,北京大学生命科学学院,北京大学蛋白质工程和植物基因工程国家重点实验室,北京,100871 2. 北京放射医学研究所,北京,100850 3. 国医学科学院,肿瘤研究所,肿瘤医院,细胞和分子生物实验室,北京,100021 |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863)资助项目(2002AA231051). |
| 摘 要： | 利用IPI和GenBank，收集了与凋亡相关的5 333条基因序列，用一定的标准，整合筛选得到1 384个凋亡相关的基因．通过亚细胞定位、组织表达差异显著性分析、自然正义/反义RNA对预测、基因簇在pathway上的定位、蛋白质/蛋白质相互作用等方面的分析发现，一些基因只在一个组织里显著差异表达，一些基因存在自然正义/反义RNA对现象，一些基因簇同时位于多条pathway等重要信息．同时，制作了一张凋亡相关基因的寡核苷酸芯片，并且对于一对NAIF1表达质粒转染前后的HeLa样品，通过该芯片的筛选，得到24个差异表达的基因．发现NAIF1过表达诱导的细胞凋亡，伴随了PAX2、PDCD8、PDCD10、DFFA、CASP7等基因表达的显著变化，同时还发现，U58668，该mRNA没有任何基因或蛋白质的注释信息，当camptothecin诱导U937细胞系凋亡时上调，在这里的NAIF1过表达诱导的HeLa细胞系中也上调(上述数据结果见http://gpcrome.cbi.pku.edu.cn:2005/chip)． |
| 关 键 词： | 凋亡，生物信息，NAIF1，生物芯片 |
| 收稿时间： | 2008/4/16 0:00:00 |
| 修稿时间： | 5/7/2008 12:00:00 AM |
Analysis and Preparation of Oligonucletide Microarray of Apoptosis-related Genes |
|
| Huang Mo-Li,SUN Dao-Chun,LOU Ya-Xin,YIN Yan-Bin,LI Chuan-Yun,ZHANG Yong,GAO Ge,WANG Sheng-Qi,BO Xiao-Chen,WEI Li-Ping and LI Song-Gang.Analysis and Preparation of Oligonucletide Microarray of Apoptosis-related Genes[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2008,35(12):1451-1460. | |
| Authors: | Huang Mo-Li SUN Dao-Chun LOU Ya-Xin YIN Yan-Bin LI Chuan-Yun ZHANG Yong GAO Ge WANG Sheng-Qi BO Xiao-Chen WEI Li-Ping and LI Song-Gang |
| Institution: | Center of Bioinformatics, National Laboratory of Genetic Engineering and Protein Engineering,College of Life Sciences,Peking University, Beijing 100871, China;Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing 100850, China;Laboratory of Cell and Molecular Biology, Cancer Institute & Cancer Hospital, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100121, China;Center of Bioinformatics, National Laboratory of Genetic Engineering and Protein Engineering,College of Life Sciences,Peking University, Beijing 100871, China;Center of Bioinformatics, National Laboratory of Genetic Engineering and Protein Engineering,College of Life Sciences,Peking University, Beijing 100871, China;Center of Bioinformatics, National Laboratory of Genetic Engineering and Protein Engineering,College of Life Sciences,Peking University, Beijing 100871, China;Center of Bioinformatics, National Laboratory of Genetic Engineering and Protein Engineering,College of Life Sciences,Peking University, Beijing 100871, China;Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing 100850, China;Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing 100850, China;Center of Bioinformatics, National Laboratory of Genetic Engineering and Protein Engineering,College of Life Sciences,Peking University, Beijing 100871, China;Center of Bioinformatics, National Laboratory of Genetic Engineering and Protein Engineering,College of Life Sciences,Peking University, Beijing 100871, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | apoptosis bioinformatics NAIF1 microarray |
| 本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录！ | |
| 点击此处可从《生物化学与生物物理进展》浏览原始摘要信息 | |
| 点击此处可从《生物化学与生物物理进展》下载免费的PDF全文 | |