| Enrich_analysis.pl,差异表达基因富集分析的perl脚本 |
| |
| 引用本文： | 李旭凯,王钇杰,王俊杰.Enrich_analysis.pl,差异表达基因富集分析的perl脚本[J].生物信息学,2018,16(3):178-183. |
| |
| 作者姓名： | 李旭凯 王钇杰 王俊杰 |
| |
| 作者单位： | 山西农业大学生命科学学院;特色杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室;农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室;山西农业大学农学院 |
| |
| 摘 要： | 如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战。富集分析为解决这一问题提出了合理的方案。用Perl语言写了一个脚本——Enrich_analysis.pl,可根据基因注释信息进行基因富集分析,并利用Fisher's Exact Test做检验。富集分析先根据生物学知识将基因归类,然后进行基因差异表达分析,提高数据的可解释性。并利用3篇SCI文章的差异基因数据,对本perl脚本进行了对比测试,证明本perl脚本算法正确可靠。
|
| 关 键 词： | Enrich_analysis.pl perl脚本 富集分析 Fisher-s Exact Test 检验 |
| 收稿时间： | 2017/10/9 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/3/21 0:00:00 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《生物信息学》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《生物信息学》下载免费的PDF全文 |
|
