基于约束建模法的结核菌H37Rv代谢网络分析

基于结核分枝杆菌国际标准强毒株H37Rv菌株的基因组尺度代谢网络模型iNJ661进行分析,以寻找代谢网络中培养基的关键成分和必要基因.该研究在Matlab平台上利用COBRA工具箱,采用基于约束的建模方法进行动态生长模拟、解空间抽样在酶活性水平上的具体化和基因删除模拟实验.结果发现培养基成分中铵盐、三价铁盐、磷酸盐、硫酸盐、甘油等可影响H37Rv的生长;培养基中去除磷酸盐后十种酶均在不同程度上受到抑制,其中丙糖磷酸异构酶、3-磷酸甘油醛脱氢酶、磷酸甘油酸变位酶、烯醇酶受限明显.通过基因删除得出188个必要基因以及非必要基因中的16个致死基因对.基于约束建模分析可初步了解结核杆菌H37Rv菌株代谢网络的性质,可为后续相关研究提供参考和借鉴.     

数学模型在顺铂等渗性腹腔化疗中的应用研究

通过6只犬的腹腔化疗,测得腹腔液、股静脉和门静脉的血药[浓度,以及数理模型的推导,给出顺铂在体内药物扩散、药物吸收及吸收速度函数。其结果不仅给临床顺铂腹腔化疗提供理论依据而且提出研究体内药物释放,药物吸收量及药物吸收速率的方法。