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为更好地挖掘八角(Illicium verum)挥发油合成相关基因,该文对挥发油性状差异显著的优良无性系桂角69号及普通品种砧01号叶片进行了转录组测序及组装注释,并对差异表达基因进行了GO分类和KEGG通路分析。结果表明:(1)转录本经组装后获得84 182条序列,使用NR、NT、Swiss-Prot、KEGG、KOG、GO和Pfam数据库进行序列比对,共注释了59 161条序列,筛选出30 572个差异表达基因。与砧01号相比,桂角69号叶片中上调基因有15 025个,下调基因有15 547个。(2)GO分类结果显示共有20 287个差异基因被注释。KEGG分析结果表明,有21 600个差异基因被注释到133条KEGG通路上,其中挥发油合成相关的单萜生物合成通路、萜类骨架生物合成通路、苯丙素合成通路中的芳樟醇合酶、月桂烯合酶、香叶基香叶基焦磷酸合酶、肉桂酰辅酶A还原酶、咖啡酸3-O-甲基转移酶、肉桂醇脱氢酶等关键酶基因呈差异表达。(3)转录因子分析发现差异表达基因分布于31个转录因子家族,其中MYB家族序列数量最多。该文利用转录组测序技术分析八角优良无性系与普通品种叶片的差异基因及... 相似文献
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[摘要] 目的:分析食管鳞癌和正常食管上皮细胞蛋白质的表达差异,获取鉴别两者的分子标志物。方法:通过激光捕获显微切割技术分离ESCC肿瘤细胞和癌旁上皮细胞,通过双向电泳和质谱技术鉴定表达异常的蛋白,并通过蛋白免疫印记证实部分差异蛋白的表达。结果:建立了食管癌组织和正常食管上皮蛋白的双向凝胶电泳图谱,通过质谱技术鉴定出14-3-3 protein ε、S100A9等蛋白在食管癌变时差异表达,蛋白印记结果证实14-3-3 protein ε、S100A9的表达量在食管癌变时分别上调和下调。结论:激光捕获显微切割是蛋白质组研究中的一个突破性的技术,可以有效地解决组织异质性的问题;本实验检测到的差异蛋白例如14-3-3 protein ε、S100A9可能成为鉴别食管癌组织和正常食管上皮特异性的分子标记物。 相似文献
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