拟南芥CAX1转运体蛋白的跨膜拓扑结构预测

目的：对拟南芥的CAX1蛋白进行跨膜结构预测,构建CAX1的跨膜结构模型。方法：以生物信息学工具Signal 3.0、Conpred Ⅱ、TMHMM 2.0、HMMTOP、MEMSAT3、ConPred2分析拟南芥CAX1蛋白的一级序列。结果：模型显示CAX1共有10个跨膜区,分别为氨基酸残基73-93,128-147,163-185,198-219,236-256,286-307,322-344,357-379,387-407,414-432。结论：与现有的资料相印证,此模型可以作为CAX1功能研究的参考模型。     

拟南芥CRKs家族自抑域序列的预测

目的:以拟南芥CDPKs激酶家族为摹本,推测类结构激酶家族CRKs的自抑域.方法:以生物信息学工具phylip3.65和clustalx1.83对CDPK家族和CRK家族进行进化树构建平和多重序列比对分析.结果:结果显爪CDPK亚家族Ⅳ与CRK家族的相似程度很高,且自抑域序列区域非常保守.以此为依据预测了CRK家族各成员的自抑域序列.