新疆野苹果AP2/ERF转录因子家族鉴定与响应腐烂病的表达分析北大核心CSCD

AP2/ERF转录因子家族参与了植物生长发育、抵抗胁迫以及植物激素响应等诸多生物过程,是植物中最重要的转录因子家族之一。该研究基于腐烂病菌侵染后的新疆野苹果(Malus sieversii)全长转录组,使用AP2保守结构域的隐马可夫模型PF00847,鉴定新疆野苹果的AP2/ERF家族成员。利用MEGA6、NCBI CDD-batch、MEME、EXPASY、BUSCA对MsAP2/ERF家族成员进行鉴定、分类和结构分析、理化性质和亚细胞定位分析。通过RNA-seq数据和qRT-PCR实验对差异表达的MsAP2/ERFs基因的表达水平进行分析和验证,旨在鉴定新疆野苹果中潜在具有腐烂病抗性的AP2/ERF家族基因资源。结果显示:(1)在新疆野苹果中共鉴定获得106个AP2/ERF基因,涵盖全部AP2(17个)、ERF(57个)、DREB(25个)、RAV(5个)和Soloist(2个)5个亚家族。(2)进一步的细化分类发现MsERF亚家族包括B1-B6 6个组,而MsDREB亚家族中只有A2、A4、A5、A6共4个组,缺少A1和A3组的基因成员。(3)RNA-seq表达模式分析结果表明,29个MsAP2/ERF基因在腐烂病感染过程中差异表达,其中MsERF亚家族中差异表达基因数量最多(19个)。(4)12个MsAP2/ERF代表基因的qRT-PCR结果表明:8个ERF亚家族基因均受腐烂病病菌诱导显著上调表达,其中B4类ERF成员基因(MsERF40)在腐烂病病菌侵染后5 d表达量上调表达倍数最高;4个MsDREB基因中,3个受到腐烂病病原菌诱导显著上调,1个下调表达;此外,含有TIR保守结构域的MsERF05在腐烂病病菌侵染1 d后上调表达69倍,表明ERF亚家族的MsERF40和MsERF05在新疆野苹果抗腐烂病过程中发挥重要作用。该研究结果为新疆野苹果AP2/ERF基因响应腐烂病的功能和机理研究奠定了基础。     

2020年7月至2021年5月广州地区儿童脑炎的流行病学和病因学研究

为了解广州地区儿童脑炎的临床症状、病因类型、流行病学特点,评估儿童的临床指标与脑炎严重程度的关系,本研究选取2020年7月至2021年5月于广州市妇女儿童医疗中心神经内科因脑炎住院且年龄<18岁的儿童作为研究对象,通过医院病案系统回顾性收集患儿的临床资料和病原体检测信息进行统计学分析。结果显示,脑炎患儿最常见的症状为发热,其次为抽搐。广州地区儿童脑炎最常见的类型是感染性脑炎,以单纯疱疹病毒感染最为常见,并且存在季节性流行趋势,发病人数在春季达到高峰。此外,肺炎支原体是引起感染性脑炎的第二大病原体。细菌感染多发生在1岁以下儿童,以大肠埃希菌和肺炎链球菌为主,但仍有一半以上的儿童不能明确病因。年龄<1岁的儿童住院时间最长,但1岁～4和≥5岁脑炎患儿的住院时间无统计学差异。发热或伴有支气管肺炎的患儿住院时间相对较长;细菌性脑炎患儿的住院时间最长,但自身免疫性脑炎和病毒性脑炎患儿的住院时间不存在统计学差异。因此,本研究初步了解了广州地区儿童脑炎的病因构成以及常见病原体的流行特点,未来还应加强感染性脑炎的流行病学和病原学监测,研发新的病原体检测技术,从而有效的降低儿童脑炎的发生。