成人多能祖细胞的研究进程

成人多能祖细胞(multipotent adult progenitor cells,MAPC)最初是从骨髓中分离出来的一种稀有的类似于胚胎外内皮细胞的细胞,与骨髓基质干细胞相比,其生物学性状更加稳定,扩增120代不衰老,分化能力更强,因此受到越来越多的干细胞研究者的青睐。该文将就MAPC的发现、发展过程及前景作一综述。     

肠道菌群与病毒性肺炎关系的研究进展

在21世纪头20年里,呼吸道病毒造成的地区性乃至世界性的流行已经发生多次,而疫情的暴发严重威胁人类健康与生存,但临床上,仍缺乏针对病毒的特异性治疗手段。随着肠道微生态相关研究的广泛开展,肠道菌群在哮喘,纤维化及细菌性感染等多种肺部疾病的发病及防治中发挥着重要作用,成为"肠-肺轴"的关键枢纽。病毒性肺炎与肠道微生态间也存在着紧密的相互联系,通过改善肠道菌群,对呼吸病毒感染具有较好的防治作用。其内在机制主要涉及到:通过增强肠道黏膜屏障功能、减少继发性细菌的感染;通过菌体成分或者代谢产物如短链脂肪酸,色氨酸代谢产物等提高固有样淋巴细胞(Innate lymphoid cells,ILC)、单核-巨噬细胞、树突状细胞、自然杀伤细胞(Natural killer,NK)、粒细胞等固有免疫细胞的抗病毒免疫功能及调节Th17/Treg平衡抑制过度的炎症反应等。本文将系统回顾已发表的文章,对肠道菌群在病毒性肺炎方面的研究作系统的阐述,以求为研究者在病毒性肺炎的机制探究和防治方面提供帮助。     

新型冠状病毒PLpro蛋白酶结构与功能的生物信息学分析

2019年12月,由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在中国武汉暴发。SARS-CoV-2的基因组编码2种病毒蛋白酶,即木瓜样蛋白酶(Papain-like protease,PLpro)和3C样蛋白酶(3C-like protease)。其中PLpro是SARS-CoV-2复制酶复合体(RC)形成的重要调节蛋白分子,对于病毒基因组转录和复制至关重要。因此,将SARS-CoV-2 PLpro作为药物的靶点对COVID-19的治疗具有积极意义。本研究应用生物信息学工具分析新型冠状病毒的木瓜样蛋白酶的结构和功能,首先利用BLAST和BioEdit获取SARS-CoV-2 PLpro蛋白酶(SC2-PLpro)及其同源蛋白的氨基酸序列,并利用BLAST和MEGA 6.0进行同源性分析。之后,利用ProParam和Proscale分别对SC2-PLpro蛋白酶的理化性质、亲水性和疏水性进行分析。然后,通过SOMPA、ScanProsite和InterPro分别预测SC2-PLpro蛋白酶的二级结构和功能区域,进一步利用SignalP 4.0和TMHMM对SC2-PLpro蛋白酶的信号肽和跨膜区进行分析。最后,通过SWISS-MODEL对SARS-CoV-2 PLpro蛋白酶进行三级结构同源建模。结果显示,对SARS-CoV-2 PLpro蛋白酶与已报道的PLpro蛋白酶进行多序列比对后,发现SARS-CoV-2 nsp3的746~1063段氨基酸与多种冠状病毒PLpro蛋白酶氨基酸序列高度相似。同时,同源性分析发现SARS-CoV-2与蝙蝠冠状病毒的PLpro蛋白酶具有同源性,其中与QHR63299、AVP78030相似性最高。对SC2-PLpro进行理化性质预测结果显示,其由318个氨基酸所组成,为稳定亲水性蛋白。二级结构预测结果显示SC2-PLpro主要含有α-螺旋、延伸链、β-转角、无规卷曲,四种结构贯穿整条氨基酸链。进一步进行功能分析,发现其具有完整的催化三联体、锌结合域、泛素样N末端结构域,故推测该蛋白具有去泛素化的功能。然后,信号肽假说和跨膜结构域分析结果表明,SC2-PLpro既不是分泌蛋白,也不属于跨膜蛋白。本研究提示,生物信息学分析SC2-PLpro为稳定性亲水蛋白,属于非跨膜蛋白,比较保守,具有去泛素化的功能,利用此功能可以进一步规避宿主的固有免疫反应。通过制备PLpro蛋白酶小分子抑制剂,可能有助于治疗新型冠状病毒肺炎。     

趋化因子CXCL14在SLE患者外周血单个核细胞中的表达及启动子甲基化分析

目的：分析趋化因子CXCL14在系统性红斑狼疮（SLE）患者外周血单个核细胞（PBMC）中的表达及其启动子甲基化特征。方法：收集28例SLE患者和20名健康人外周血单个核细胞（PBMC）标本,抽提细胞中RNA,逆转录后,以GAPDH为内参,通过定量PCR检测PBMC中CXCL14的表达,统计分析CXCL14表达水平与SLE各种临床资料的相关性,探讨PBMC中CXCL14表达与SLE的关系,通过重亚硫酸盐修饰的全基因组DNA用以BSP测序来明确不同标本中CXCL14启动子中甲基化位点的甲基化率。结果：CXCL14在SLE患者和正常人PBMC中的表达量存在显著差异（P < 0.05）。与健康人PBMC中CXCL14的含量相比较,CXCL14在SLE患者PBMC中表达量显著降低。与进一步CXCL14表达水平与SLE各种临床资料的相关性分析显示,CXCL14表达水平与SSB抗体（干燥综合征B抗体）、蛋白尿及血小板计数相关。与SSB抗体阴性SLE患者比较,SSB抗体阳性患者CXCL14表达水平更低（P <0.05）;与蛋白尿阴性SLE患者相比,蛋白尿阳性患者CXCL14表达水平更低（P < 0.05）;而血小板升高患者的CX-CL14表达水平更高（P < 0.05）。CXCL14表达水平与SLE活动、肾损害指标、抗ds-DNA、C反应蛋白（CRP）、补体C3水平等指标未见显著相关性。CXCL14启动子区甲基化分析显示,SLE患者CpG岛甲基化明显高于正常对照。结论：PBMC中低表达的CXCL14与SLE发生发展相关,其启动子区CpG岛过度甲基化是SLE患者CXCL14低表达的重要机制。     

N端9个氨基酸缺失对恶性疟融合抗原免疫原性的影响

由两个疟疾疫苗候选抗原AMA 1(III)和MSP1 19融合而成的恶性疟原虫融合抗原 2 (PfCP 2 ) ,是一个很有应用前景的疟疾疫苗候选抗原。但PfCP 2表达产物为双带型 ,这影响到该疫苗候选抗原作为产品进入临床试验。为此分析了表达产物N末端的氨基酸序列 ,发现其中低分子量条带的N末端不完整 ,缺失 9个氨基酸。进一步用PCR技术对PfCP 2进行改建 ,使其N末端缺少 9个氨基酸 ,产生PfCP 2 .9基因。实验结果显示 :PfCP 2 .9在毕赤酵母中的表达产物为单一条带 ,且在表达水平、二硫键依赖的构象、免疫原性及免疫血清抑制疟原虫生长等方面与PfCP 2一致。PfCP 2表达产物双带型问题得到解决 ,为该融合抗原疟疾疫苗进入临床试验排除了重要障碍。     

自然流产胚胎组织解脲脲原体检测分析

初步探讨解脲脲原体（Uu）感染与自然流产的相关性。对82例自然流产,44例人工流产（对照组）的胚胎组织进行Uu的人工分离培养,并对部分组织的超薄切片及培养物负染片置电镜下观察。结果显示,自然流产胚胎组织Uu的检出率为64．6％（53．82）,与对照组相比6．8％（3／44）,具有显著性差异（P＜0．001）;电镜下观察,Uu检出阳性标本中合体滋养细胞和细胞滋养细胞膜表面见大量的Uu颗粒,与阳性培养物经负染后了颗粒相似,而Uu阴性对照标本中未见此颗粒,提示：Uu可引起宫内感染,损伤绒毛膜滋养细胞,是导致自然流产的重要病原体之一。     

系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞中HCMV基因表达谱及其特异性抗体特征

人类巨细胞病毒（Human cytomegalovirus,HCMV）感染是系统性红斑狼疮（Systemic lupus erythematosus,SLE）的重要病因,并会加剧疾病进展。然而,SLE患者外周血单个核细胞（Peripheral blood mononuclear cell,PBMC）中HCMV基因的表达谱及其特异性抗体特征尚未完全阐明,并且HCMV蛋白特异性抗体水平与SLE患者临床特征的相关性尚未得到证实。通过Poly(A)建库的mRNA转录组测序（Poly(A)RNA-Seq）检测3例SLE患者和3例健康对照者（Healthy control,HC）的PBMC中的HCMV基因表达谱。然后在10例SLE患者和10例HC的链特异性建库的mRNA转录组测序（strand-specific RNA-seq）结果中验证检测到的HCMV基因。除此之外,通过免疫信息学分析筛选HCMV基因的B细胞表位。ELISA用于检测120例SLE患者和75例HC血清中的HCMV特异性抗体水平,并将其与患者的临床特征相关联。本研究在SLE患者和HC的PBMC中检测到8个HCMV基因。免疫信息学分析...