NgAgo-gDNA基因组编辑系统的成功及启示

韩春雨等发明的DNA指导的基因组编辑系统NgAgo-gDNA,比原有的RNA指导的基因组编辑系统CRISPR-Cas9在靶向特异性(防脱靶),反应可控性和基因组编辑范围等方面都有显著的改进。NgAgo-gDNA不是一项简单的改进,是一项具有开拓性的工作,沿着这条研究路线,可以继续开发出更先进的基因组编辑系统。该研究充分体现了生物信息学,特别是大数据挖掘在未来生命科学研究中的重要地位。本文仅从生物信息学角度,谈谈这项研究的价值、意义以及可能引发的相关研究方向。     

小球藻的玻璃化超低温保存法

先用含0.5 m01·L-1甘油和0.4 mol·L-1蔗糖的预处理液处理20min,然后用含30%蔗糖 15%乙二醇 10%二甲基亚砜 BBMG培养液的玻璃化液处理,在0℃下预冻60min后,将小球藻投入液氮.此法存活率较高,可达到60.14%,小球藻种质保存效果较好.通过试验初步建立了小球藻玻璃化法超低温保存的技术程序.     

辣椒属种间杂种F_1植株的细胞遗传学研究

本文分析了南京早椒（ＣａｐｓｉｃｕｍｆｒｕｔｅｓｃｅｎｓＬ．ｖａｒ．ＣｏｎｏｉｄｅｅｓＢａｉｌｅｙ）和Ｃ．ｃｈｉｎｅｎｓｅ二亲本及Ｆ１杂种花粉母细胞减数分裂终变期和中期Ｉ染色体配对的构型。结果表明：二亲本花粉母细胞减数分裂染色体配对均正常,为１２个二价体（双单倍体２ｎ＝２４）。Ｆ１杂种花粉母细胞减数分裂染色体配对很不规则。其平均频率分别为单价体０．０３６,二价体９．１８,三价体０．０３６,四价体０．８０,六价体０．３８。南京早椒和Ｃ．ｃｈｉｎｅｎｓｅ染色体间存在着相互易位,因此,二亲本间彼此有差异。单价体出现极少,这可断定南京早椒与Ｃ．ｃｈｉｎｅｎｓｅ染色体间是部分同源的,但染色体组结构上存在着差异。由于染色体结构上差异,所以Ｆ１杂种的育性较低。     

葡萄基因组密码子使用偏好模式研究

根据完整基因组序列,运用多元统计分析和对应分析的方法,探讨了葡萄全基因组序列密码子的使用模式和影响密码子使用的各种可能因素。结果显示:葡萄密码子偏好性主要受到碱基差异(r=0.925)和自然选择(r=0.193)共同作用的影响,突变压力占了主导因素,自然选择的作用较小。同时基因长度和蛋白质疏水性也对密码子的偏好性有所影响。确定了葡萄的20个最优密码子。     

某汉族脐带血DNA库父母籍贯及姓氏构成的分析

为了评价以医院为单位整群抽样获取的脐带血DNA库与一般人群的相似性,对北京某医院收集的脐带血DNA库提供者父母籍贯和姓氏分布进行统计分析。以该医院产科连续出生的566名汉族新生儿及其父母为研究对象,收集产妇及其丈夫的姓名、籍贯等资料,分析新生儿父母籍贯和姓氏的分布与构成,并与全国和北方汉族人群姓氏构成频率和构成顺位进行比较。DNA库中父母籍贯北京的占45．1％～49．8％,河北、山东、河南、江苏的比例较高(3．7％～10．6％),父母籍贯覆盖全国30个省、市、自治区(除西藏、贵州),但多数地区所占的频率较低。父亲姓氏146个、母亲姓氏145个,其中构成比大于1．5％的姓氏有9个。父亲姓氏前8位为：王(9．0％)、李(8．0％)、张(7．8％)、刘(7．1％)、杨(4．1％)、陈(3．5％)、赵(3．4％)、高(1．6％),母亲姓氏前8位为：王(11．8％)、李(8．3％)、张(7．8％)、刘(6．4％)、赵(3．7％)、陈(3．4％)、孙(2．8％)、杨(2．7％)。父母姓氏合并后的前7位姓氏为：王(10．42％)、李(8．13％)、张(7．77％)、刘(6．7l％)、赵(3．53％)、杨(3．36％)、陈(3．45％),其分布频率与北方地区人群(王9．87％、李9．28％、张9．13％、刘6．68％、赵3．56％、杨3．04％、陈2．51％)相似(X^2=8．54,df=6,P=0．20),其顺位除杨、陈与北方地区人群颠倒外．其余的顺位一致。提示在北京某医院整群抽样的汉族新生儿脐带血DNA库父母的籍贯和姓氏构成接近北方汉族人群的特征．进一步改进抽样方法有可能获得符合基因群体研究要求的脐带血DNA库。