云南大理太极山自然保护区广义虫草物种多样性

太极山自然保护区位于云南大理白族自治州, 地处弥渡、巍山、南涧三县交界处, 具有复杂的生态系统和丰富的生物资源。为探明太极山自然保护区虫草物种多样性, 对该地区进行野外调查, 通过形态观察和多基因 (nrSSU、nrLSU、EF1-α、RPB1和RPB2)系统发育分析进行虫草物种鉴定。调查共收集和鉴定虫草标本117份, 隶属于2科5属, 包括虫草科Cordycipitaceae中的虫草属Cordyceps(3种, 其中疑似新种1个), 白僵菌属Beauveria(3种), Samsoniella(1疑似新种), 线虫草科Ophiocordycipitaceae中的多头霉属Polycephalomyces(1疑似新种)和线虫草属Ophiocordyceps(2种)。基于α物种多样性分析计算该地区物种多样性指数(Simpson指数为0.75, Shannon.Wiener指数为1.62, Pielou Evenness均匀度指数为0.70)。太极山自然保护区优势物种为蛹虫草Cordyceps militaris, 共采集标本45份。虫草寄主主要涉及鳞翅目、鞘翅目和革翅目昆虫。本次虫草资源调查补充了云南虫草生物多样性资源数据库, 有利于云南虫草生物多样性保护与可持续利用。     

红边龙血树叶绿体基因组特征及其系统发育分析

红边龙血树(Dracaena marginata)是一种在全球广泛种植的龙血树属园艺植物,具有较高的观赏价值和药用价值。本研究首次利用高通量测序技术对红边龙血树叶片进行全基因组测序,组装得到完整的叶绿体基因组序列,并进行注释、序列特征比较和系统发育分析。结果表明,红边龙血树叶绿体基因组包含一个典型的四分体结构,长度为154926 bp,是目前已报道的龙血树属中叶绿体基因组最小的物种;共拥有132个基因,包含86个编码蛋白基因、38个转运RNA基因和8个核糖体RNA基因;密码子偏好性分析发现存在偏好使用A/U碱基结尾的现象,整体上密码子偏好性较低;共鉴定出46个简单重复序列位点和54个长重复序列,分别在大单拷贝区与反向重复区有最大检出率;种间边界分析发现边界区域基因存在相对位置差异,扩张收缩情况总体较为相似;与近缘种进行系统发育分析,红边龙血树与细枝龙血树聚为一类,关系最近,符合形态学分类特征。对红边龙血树叶绿体基因组的解析为龙血树属植物的物种鉴定、遗传多样性和叶绿体转基因工程等提供了重要数据基础。