鹿源BVDV基因E_0蛋白特性分析

以DNAStar5.01软件,对鹿源BVDV基因E0蛋白特性进行了分析。结果表明E0蛋白由227个残基构成,等电点为7.61。E0蛋白中有与地衣类植物核苷酸酶的保守区域相似序列,维持催化活性所必需的氨基酸残基区域在28-40和71-89处,催化活性的氨基酸为His30、His79,且该序列高度保守。E0蛋白氨基酸亲水性与抗原性指数成平行相关,BVDV各毒株间非常相似,亲水性与抗原性指数都较高的区域有8-16,23-29,59-67,70-81,96-109,114-122,127-134,137-143,165-172,186-198和213-221,适合研制亚单位基因工程疫苗。     

鹿源牛病毒性腹泻病毒E0基因的RT—PCR扩增

用RT—PCR方法,成功扩增了鹿源牛病毒性腹泻病毒保护性抗原E0基因。该RT—PCR最佳反应条件分别为退火温度为55℃、25mmol／uL MgCl2（4uL）、10pmol／uL上下游引物（2uL）、5u／uL Taq酶（1uL）。     

梅花鹿源BVDV基因E0克隆与序列分析

对梅花鹿源BVDV基因E0进行了克隆和序列分析。结果表明,梅花鹿源BVDV基因E0的大小为681bp,与报道9株BVDV（VEDEVAC、Bega、C24V、ILLC、NADL、OSLOSS、R1935、SD-1、Y546）和7株猪瘟病毒（ALD、Bres-cia、c、GPE、JL、LN9912、SM）及3株羊边界病毒（BD31、C413、BDVX818）相比,核苷酸序列的同源性依次为98.6%～84.8%、76.1%～74.7%、77.0%～76.7%。梅花鹿源BVDV为Ιb基因亚型。