多约束代谢网络模型的研究进展

基于约束的基因组尺度代谢网络模型(genome-scale metabolic models,GEMs)分析已被广泛应用于代谢表型的预测。而实际细胞中代谢速率除计量学约束外,还受到酶资源可用性和反应热力学可行性等其他因素影响,在GEMs中整合酶资源约束或者热力学约束构建多约束代谢网络模型可以进一步缩小优化解空间,提升细胞表型预测的准确性。文中主要对近年来多约束模型的研究进展进行了综述,介绍了不同多约束模型的构建方法,以及其在研究基因敲除影响、预测可行途径和提供代谢瓶颈信息等方面的应用。将多种约束条件进一步与代谢模型整合,可更准确地预测细胞代谢的瓶颈和关键调控改造靶点,从而为工业菌种代谢工程改造提供精确的设计指导。     

海洋真菌Diaporthe sp.产真菌环氧二烯发酵条件的优化*

从海洋木栖真菌HLY-2分离得到的真菌环氧二烯(Mycoepoxydiene)是新发现的高抗肿瘤活性化合物。通过正交设计,改良普通半海水PD培养基的配方,比较固体和液体两种发酵方法,得到了使该化合物产量大幅提高的最佳培养条件:在固体发酵条件下土豆250g/L,海水300mL/L,葡萄糖30g/L,乳糖50g/L,磷酸二氢钾0·65mmol/L,硫酸铵1g/L,产量高达543mg/L,比普通的PD培养基提高了43倍,也比液体发酵的最高产量提高了近15倍。同时还对固体发酵和液体发酵造成的产量差异进行了分析。并     

基于多源地理数据精细尺度的武汉市人居环境新型冠状病毒肺炎疫情传播风险评估

新型冠状病毒肺炎的迅速传播和扩散警示着疾病风险评估的重要性。但现有的风险评估方法受数据限制，缺少实时性和准确性。此外，多数研究以行政统计单元作为分析尺度，存在可变面元问题。为解决这些问题，耦合精细尺度下武汉市疫情数据及多源地理数据，基于随机森林算法构建社区尺度的市域疫情传播风险评估模型并进行了疫情风险制图。模型测试精度达到0.85，Kappa系数达到0.70。此外，本研究还建立基于随机森林算法的社区及场所尺度的"空间变量-感染风险"模型，评估了不同场所设施疫情传播的风险程度。研究表明，（1）武汉中心区域感染风险最高并呈现出向外围递减的趋势；（2）感染风险排名前五的一级场所类型分别为购物服务、医疗服务、金融服务、交通设施以及公共设施；（3）小学、中学的疫情传播风险较低，而高等院校传播风险较高；（4）社区尺度下的疫情风险程度，预测购物场所与交通场所是疫情传播风险最高的驱动因子。本研究基于精细尺度提出风险评估新方法，可为未来疾病风险评估提供新思路，为疫情防控提供决策支持，人民群众提供安全保障。     

海洋真菌Diaporthe sp.产真菌环氧二烯发酵条件的优化

从海洋木栖真菌HLY-2分离得到的真菌环氧二烯(Mycoepoxydiene)是新发现的高抗肿瘤活性化合物。通过正交设计,改良普通半海水PD培养基的配方,比较固体和液体两种发酵方法,得到了使该化合物产量大幅提高的最佳培养条件:在固体发酵条件下土豆250g/L,海水300mL/L,葡萄糖30g/L,乳糖50g/L,磷酸二氢钾0·65mmol/L,硫酸铵1g/L,产量高达543mg/L,比普通的PD培养基提高了43倍,也比液体发酵的最高产量提高了近15倍。同时还对固体发酵和液体发酵造成的产量差异进行了分析。并检验了发酵产物的抗肿瘤活性。     

封闭群FMMU白化豚鼠与短毛三色豚鼠血液成分比较

测定比较了２０日龄的封闭群ＦＭＭＵ白化豚鼠与短毛三色豚鼠３５个血液生理生化指标,结果表明：雄性白化豚鼠的钾、葡萄糖、甘油三脂、总蛋白、红细胞总数、红细胞分布宽度明显高于雌性白化豚鼠,其它项目差异不显著;对两种豚鼠的血液成分测定结果比较发现,ＦＭＭＵ白化豚鼠的氯、磷、尿素氮、葡萄糖、淋巴细胞百分数和红细胞分布宽度比三色豚鼠的低,而尿酸、中间细胞总数、血小板总数,平均血小板容积和平均血小板比容比三色豚鼠的高。