鸡公山风景区针阔混交林藤本植物在树干不同方位的依附规律北大核心CSCD

为了揭示森林藤本植物在树干表面的分布规律,在鸡公山风景区的枫香(Liquidambar formosana)-马尾松(Pinus massoniana)针阔混交林内,采用样方法和定量调查法分析了以气生根为攀缘策略的络石(Trachelospermum divaricatum)在枫香和马尾松树干表面不同方位分布的数量差异。结果表明,络石在枫香和马尾松树干不同方位的分布状况因树高而异。在枫香树干基径(5 cm)处,西北方位附着的络石数量(6.6 ind./tree)显著高于东北方位(4.6 ind./tree)和东南方位(4.3 ind./tree);在胸径(130 cm)处,西南和东南方位附着的络石数量则显著高于西北方位;络石在基径和胸径处的死亡率均表现为南侧低,北侧高。在马尾松基径处,西北方位的络石具有最高的死亡率(35.1%),导致存活数量最少(4.6 ind./tree);胸径处则东南方位络石最多;并且南侧的络石死亡率低于北侧。因此,络石在攀缘林木不同方位的分布存在显著差异,且与树干高度和林木胸径密切相关,这是树干微环境和藤本植物自身生理特征共同作用的结果。     

耐草甘膦菌株Pantoea rodasii S1536全基因组测序及比较基因组分析

耐草甘膦菌株泛菌属S1536 (Pantoea rodasii S1536)是从草甘膦污染土壤中分离筛选出来的一种革兰氏阴性菌,对草甘膦的抗性能高达400 mmol/L。本研究首次通过PacBio RSII平台对泛菌属S1536进行全基因组测序,使用SMRT portal软件对reads进行组装,获得10个contigs,最终获得高质量且无间隔的泛菌属S1536基因组包含1条染色体和2个质粒,序列全长为5.16 Mb,其GC含量为55.16%。本研究进一步对基因组序列进行基因预测与功能注释、COG和GO聚类分析,预测了次级代谢产物合成基因簇及草甘膦抗性机制,最终得到编码基因有4 843个,4 656个蛋白获得COG功能注释,预测到2个NRPS类基因簇、1个thiopeptide类基因簇和1个hserlactone-arylpolyene类基因簇。莽草酸代谢途径关键酶EPSP合酶基因分析表明,泛菌属S1536中的EPSP合酶属于ClassⅠ型EPSPS。根据已报道的3株同一种Pantoea rodasii strain ND03、Pantoea rodasii strain DSM 26611和Pantoea rodasii strain LMG 26273的基因组信息进行全基因组关联比较分析,结果显示4株菌虽然属于同一种,但在进化中产生了较大差异。相关研究结果将为泛菌属S1536功能基因组学研究、耐除草剂机制的研究及耐除草剂基因的挖掘提供基础数据。