陕西省9株乙脑病毒的分离及E基因序列分析

分析陕西省分离的9株乙脑病毒基因组序列特征。使用乙脑病毒全基因组序列测定引物进行RT-PCR扩增,扩增产物进行测序,拼接后获得基因组序列。利用MEGA 4.1、MegAlin、MEGA7.0等软件进行毒株的系统进化分析,并与P3株、减毒活疫苗SA14-14-2株及覆盖5个基因型别的其他乙脑病毒进行E基因序列比对。9株分离株3株分离自猪舍、6株分离自羊舍,其中4株获得全基因组序列,5株测得E基因序列。基于E基因序列进行毒株核苷酸、氨基酸同源性比较,结果显示分离株均与基因I型GI-b亚型毒株核苷酸和氨基酸同源性最高,核苷酸同源性范围为96.5%～99.7%、氨基酸同源性范围99.2%～100.0%;与SA14-14-2株核苷酸同源性范围为87.5%～88.9%、氨基酸同源性范围96.3%～97.2%;与P3株核苷酸同源性范围为87.6%～88.1%、氨基酸同源性范围96.7%～97.6%。分析09年（陕南地区）分离株与18年（关中地区）分离株的E基因核苷酸差异率为1.8%～2.9%、氨基酸差异率为0%～0.8%。陕西省自然界中循环的乙脑病毒以基因Ⅰ型为主,与P3株在抗原毒力关键位点无差异,...     

2018年甘肃省平凉市流行性乙型脑炎病毒的分子特征

为研究甘肃省2018年蚊虫携带流行性乙型脑炎病毒(简称乙脑病毒)的分子特征,2018年7月上旬在甘肃省平凉市4个县采集蚊虫标本,采用实时荧光定量RT-PCR方法开展乙脑病毒筛查;通过高通量测序方法对乙脑病毒基因扩增阳性蚊虫标本进行深度测序研究.结果显示,本次调查在4个县共采集蚊虫1800只,均为三带喙库蚊,分36批研磨和检测.定量RT-PCR结果显示10批(27.8％)蚊虫样本呈乙脑病毒基因扩增阳性.对10批样本进行高通量测序共获得59.7 M读序,其中5.3 M(8.9％)条读序能够比对到病毒基因组数据库上,经注释属于14科15属28种病毒.在其中7批样本中检出乙脑序列共1357条,基因组覆盖度为9.5％-83.1％.系统进化分析显示甘肃省2018年采集的三带喙库蚊中乙脑病毒为基因Ⅰ型.     

基于文献计量学的中国西尼罗病毒研究特征分析

为了解我国关于西尼罗病毒（West Nile virus, WNV）文献的各项研究特征，本文应用文献计量学方法对1942-2021年中国知网（CNKI）和Web of Science(WOS)数据库收录的WNV文献进行分析。由于1999年美国出现WNV暴发流行，全球发文量显著增加，2006年达到峰值，将发文情况总体分为3个阶段：1999年之前对于WNV的关注度有限；1999-2006年，全球整体发文量大幅增加，国内文献数量随之增加，以综述和国外疫情介绍类为主；2006年后全球发文量在300篇/年左右，国内文献类型以实验研究类为主。当前研究热点主要集中在病原学机制研究、暴发疫情、监测与检测、传播媒介和传播模式等方面，而国内以检测方法的建立为主。国内WNV研究主要局限在数家国家级研究机构。鉴于中国已在局部地区发现WNV流行，在今后的研究工作中，亟需在开展WNV病原学、致病机制研究的基础上，建立全国监测体系、提高检测能力、扩大监测范围、增加检测内容，为WNV病防控策略的制定及潜在暴发流行的应对提供科学依据。