河蟹螺原体非编码RNA及其毒力靶标的多组学系统挖掘*

我国是世界最大水产养殖国,每年甲壳动物因病害造成的经济损失约为70亿元。其中,螺原体(Spiroplasma)是甲壳动物重要的致病菌之一,可造成虾蟹大面积死亡,已列入农业农村部三类疫病。非编码RNA(ncRNA)广泛存在于细菌中,其主要通过碱基配对识别靶标mRNA在转录后水平调节基因的表达,部分ncRNAs通过与蛋白质相互作用而影响蛋白质功能。近年研究表明,细菌ncRNAs在毒力调控中扮演极为重要的角色。为了研究河蟹螺原体ncRNAs在甲壳动物致病中的分子调控作用,需系统筛选鉴定螺原体感染相关的ncRNAs和毒力靶标。通过比较基因组、差异转录组、定量蛋白质组、系统生物学和分子相互作用联合研究得到:整合基因组和转录组挖掘得到河蟹螺原体ncRNAs 共54个;在体内感染和体外培养的不同时期,利用数字基因表达谱分析分别得到11个和28个差异显著ncRNAs;利用4款生物软件预测ncRNAs靶标,取交集得到423个;利用定量蛋白质组检测,鉴定出68个差异毒力蛋白,这些差异毒力蛋白与ncRNAs的30个毒力靶标中的21个相同;利用网络生物学分析得到主要的节点Hub-ncRNA共有6个;利用RNA pull-down、原核链特异性测序和LC-MS/MS综合分析,得到重要节点ncRNA SR05的互作RNA 53个、互作蛋白质120个。相关研究成果,可为诠释河蟹螺原体致病机制及其与宿主相互作用机制奠定基础,为虾蟹该疾病的综合防治提供科学依据。     

《生物资源学》教材与课程建设初探

生物资源与水资源、土地资源、矿产资源、能源资源和气候资源等都是人类赖以生存与发展的最为重要的物质基础,其中生物资源主要包括生物遗传资源、生物质资源和生物信息资源三大类型。生物资源学是现代生命科学、资源科学和工程科学等相关领域交叉和衍生出的新兴学科,已在国内外部分高校作为新专业进行开设。《生物资源学导论》是在高等教育出版社和中国生物工程学会生物资源专委会的倡议与指导下完成的国内首部生物资源系列教材,在出版后的两年多时间内,已在国内部分高等院校的课程建设中得到使用。本文简要地综述了《生物资源学导论》教材的二次开发与利用和新形态教材的建设与应用,以及《生物资源学》课程建设的基本情况,以期为我国生物资源学学科教育事业的发展尽绵薄之力。