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为探究狗牙根对水淹环境的适生性机制,取长势一致的狗牙根分为未水淹对照组(A1)和30 cm沉水处理组(A2),A2水淹15 d后两组同时采样,提取样本总RNA作转录组测序。A1和A2测序数据经de novo组装分别获得128031和83363条高质量Unigene;A1和A2对比发现28844条差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),其中11858条DEGs上调表达,16986条DEGs下调表达;功能注释显示,这些DEGs主要集中在转录、翻译、碳水化合物代谢和环境适应等途径;信号通路富集显示,包括植物对病原体的防御、物质代谢、光合作用、形态发育和抗氧化等过程的103个信号通路与狗牙根对水淹生境的适生性有关;随机挑选4个DEGs作qRT-PCR分析,荧光定量结果与测序数据基本一致,说明基于转录组分析DEGs的表达情况较为可靠。该工作或可为进一步挖掘与狗牙根水淹适生性相关的调控基因和功能基因提供基础。 相似文献
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半定量 RT-PCR 分析表明,OsGSTLc 在水稻根中的表达受绿磺隆的诱导.从水稻基因组中分离到的 OsGSTLc 读码框上游22171 bp 序列,在起始密码 ATG 上游-86 bp 处有 CAAT-box,但在 CAAT-box 与读码框之间没有典型的 TATA-box.因此,OsGSTLc 启动子是无 TATA 框启动子.将 OsGSTLc 启动子5′-端系列缺失后,分别与 GUS 报告基因融合,获得 GSTL2171：GUS 、GSTL 1761：GUS 、GSTL 962：GUS 和GSTL 525：GUS 表达载体,利用农杆菌介导转化水稻,获得转基因水稻,均能启动下游 GUS 报告基因的表达.氯磺隆处理后,转入 GSTL 2171：GUS 、GSTL 1761：GUS 和 GSTL 962：GUS 的水稻植株根部的 GUS活性明显增加.氯磺隆诱导的应答元件在-962~-525 bp 的范围内. 相似文献
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