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【目的】新金分枝杆菌(Mycobacterium neoaurum)MN4是1株经诱变育种获得的高产雄烯二酮,并且能够耐受高浓度底物植物甾醇的突变菌株。为深入研究MN4菌株耐底物的机制及雄烯二酮的生物合成途径,有必要解析MN4菌株的全基因组序列信息。【方法】本研究采用高通量测序技术对MN4进行全基因组测序,然后使用相关软件对测序数据进行基因组装、基因预测与功能注释、COG聚类分析以及次级代谢产物合成基因簇预测等。【结果】新金分枝杆菌MN4基因组装获得33个Contigs,整个基因组大小为5.39 Mb,GC含量为66.9%,编码4920个蛋白基因,序列提交至Gen Bank数据库,登录号为JXYZ00000000。【结论】本研究首次报道了1株高产雄烯二酮菌株MN4的全基因组序列,分析了基因组的基本特征,初步解析了该菌株降解植物甾醇生产雄烯二酮的关键基因,将为MN4的功能基因组学研究及相关次级代谢产物的生物合成途径与异源表达研究提供基础。 相似文献
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通过组织研磨法对南方红豆杉(Taxus wallichiana var. mairei)新鲜组织进行内生细菌的分离,利用16S rRNA测序技术对分离的内生细菌进行鉴定分析,使用高效液相色谱-高分辨飞行质谱测定菌液提取物IAA含量,利用HPLC-TOF-MS对提取物脂肽类化合物进行分离、鉴定,结合数据库筛选菌株产脂肽类化合物种类及含量差异。结果表明,从南方红豆杉根茎叶中共分离鉴定出内生细菌31株,筛选出产IAA菌株20株,其中编号为KLBMPTC10的芽胞杆菌属菌株产IAA含量高达210.3955 μg·L-1。在对产IAA菌株所产脂肽类化合物的研究中发现,菌株KLBMPTC10是所有产IAA内生细菌中脂肽类化合物含量最丰富的,其产Iturin A2相对含量为26.06%,明显优于其他产IAA菌株。芽胞杆菌属菌株KLBMPTC10同时具备高产IAA和脂肽类化合物的能力,可作为研究菌株进一步开发。 相似文献
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