利用iPBS技术克隆牡丹反转录转座子LTR序列

利用iPBS方法从西北牡丹(Paeonia suffruticosa)品种红绣球和中原牡丹品种洛阳红中扩增出相应片段,经回收、克隆及测序,获得了12条来自牡丹LTR类反转录转座子的LTR序列,并用相关生物信息学软件对序列进行分析。结果表明,这些核苷酸序列表现出较高的异质性,主要表现为缺失突变,序列长度变化范围为313–894 bp,同源性从31.1%–65.8%不等。将其氨基酸序列与已登录的不同植物LTR类反转录转座子LTR氨基酸序列进行聚类分析,结果显示与某些植物相应序列具有较高的同源性,表明可能存在LTR类反转录转座子的横向传递关系。根据克隆出的LTR序列设计SSAP引物,对牡丹29个品种进行了SSAP分子标记分析,结果显示具丰富的多态性。实验验证了用iPBS技术分离牡丹LTR序列的适用性,并为牡丹种质资源评价提供了新的技术手段。     

植物紫色酸性磷酸酶基因家族功能研究进展

紫色酸性磷酸酶(PAPs)是一类广泛存在于植物体内的金属磷酸酯酶, 其羧基端含有1个保守结构域, 由5个保守基序和7个氨基酸残基构成。作为一种特殊的酸性磷酸酶, PAPs在酸性环境下能够有效催化磷酸酯或酸酐的水解, 释放出植物可以利用的磷酸基团。此外, PAPs在调节植物碳代谢、细胞壁合成和抵御病菌侵染等方面也发挥重要生理作用。该文简要介绍了PAPs的结构、家族成员及其调控因子, 并着重总结了近年来对PAPs生物学功能的研究进展, 为今后系统开展PAPs功能研究提供了理论参考。