SARS-CoV-2 Omicron变异株荧光定量PCR鉴别方法的建立及应用

开发和评价一种用于鉴别Omicron变异株的荧光定量PCR方法。我们针对Omicron变异株S基因的两个特异性突变位点开发了一种基于荧光定量PCR的Omicron变异株分型方法（Omicron RT-qPCR）。通过测试临床样本来评价方法的特异性,通过标准品评价方法的灵敏度。Omicron RT-qPCR分型方法显示能够可靠地区分Omicron变异株和“野生型” SARS-CoV-2及Alpha、Beta、Delta变异株及甲型流感病毒。选取68例新冠疑似样本,全基因组测序（Whole genome sequencing,WGS）结果显示44例为Omicron变异株,Omicron RT-qPCR分型结果均为阳性;11例为Delta变异株,Omicron RT-qPCR分型结果均为阴性;另外,通过WGS分析未能成功分型的7例样本,通过Omicron RT-qPCR分型方法成功鉴定为Omicron BA.1和BA.2变异株。我们开发的Omicron RT-qPCR分型方法可以在普通的PCR检测实验室应用,为我国疾控系统和医疗机构及时监测SARS-CoV-2 Omicron变异株的传播提供...     

急性失代偿性心力衰竭患者血清CST、CyPA、MSTN表达及其临床意义

摘要 目的：探讨急性失代偿性心力衰竭（ADHF）患者血清儿茶酚抑素（CST）、亲环素A（CyPA）、肌肉生长抑制素（MSTN）的表达及其临床意义。方法：选取2021年4月～2022年4月潍坊市人民医院收治的100例ADHF患者为ADHF组，根据预后情况将其分为预后不良组(32例)和预后良好组（68例），另选取50名健康体检志愿者为对照组。采用酶联免疫吸附法检测血清CST、CyPA、MSTN表达。采用多因素Logistic回归分析ADHF患者预后不良的因素，采用受试者工作特征（ROC）曲线分析血清CST、CyPA、MSTN表达对ADHF患者预后不良的评估价值。结果：ADHF组血清CST、CyPA、MSTN表达高于对照组（P＜0.05）。100例ADHF患者预后不良发生率为32.00%。多因素Logistic回归分析显示，纽约心脏协会（NYHA）心功能分级≥Ⅲ级、N末端前体B型钠尿肽（NT-proBNP）、CST、CyPA、MSTN升高为ADHF患者预后不良的独立危险因素，左室射血分数（LVEF）升高为独立保护因素（P＜0.05）。ROC曲线分析显示，血清CST、CyPA、MSTN表达联合评估ADHF患者预后不良的曲线下面积（AUC）大于CST、CyPA、MSTN表达单独评估。结论：血清CST、CyPA、MSTN高表达与ADHF患者预后不良有关，联合血清CST、CyPA、MSTN表达评估ADHF患者预后不良的价值较高。     

2021年2月深圳市六株境外输入的SARS-CoV-2基因组特征分析

为了解深圳境外输入的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的遗传特征,本研究对2021年2月六株境外输入的SARS-CoV-2毒株进行了高通量测序与基因组序列分析.测序获得的六株SARS-CoV-2毒株基因组长度分别为29 450 nt、28 936 nt﹑28 875 nt、29 855 nt、29 146 nt 和29 528 nt.根据"Pango lineages"分型法,三个来自肯尼亚、南非和柬埔寨的毒株属于B.1.1.7系(VOC-202012/01),一个来自美国的毒株属于B.1.2系(美国谱系),两个来自南非和肯尼亚的毒株属于B.1.351系(20H/501Y.V2).与武汉毒株Wuhan-Hu-1(NC_045512.2)比较,B.1.1.7系毒株的刺突蛋白(S)中发现了多达10个氨基酸的变异,B.1.2系毒株的S蛋白仅发现一个氨基酸的变异,B.1.351系毒株的S蛋白中发现了多达11个氨基酸的变异.来自柬埔寨的一株B.1.1.7系毒株的S蛋白中发现了三个变异(H69S,V70I与Y144V)与另外两个B.1.1.7系毒株中的变异(H69del,V70del与Y144del)不同.六个毒株在ORF1b上都表现出了 P314L的变异,在S蛋白上都表现出了 D614G的变异.2021年2月深圳输入了传染性更强的B.1.1.7英国变异株和B.1.351南非变异株.境外输入的SARS-CoV-2变异株存在引起本地暴发与流行的风险,需持续对境外输入的SARS-CoV-2毒株进行分子监测.     

两种独行菜种子萌发生理特性研究

以两种在新疆具有代表性的十字花科独行菜属早春短命植物抱茎独行菜（Lepidium perfoliatum Linnaeus）和独行菜（Lepi-dium apetalum Willd）为材料,研究（光照、温度、外源激素ABA处理）对其种子萌发的影响。结果：两种独行菜种子萌发对光照不敏感;抱茎独行菜种子萌发的温度范围广,在0℃～25℃之间都可萌发,而独行菜种子则在低温下（0℃、4℃）不萌发,其萌发温度范围为10℃～25℃。两种独行菜种子对低温胁迫表现出不同的耐受性;0℃、4℃下,在培养基中加入不同浓度的ABA,对抱茎独行菜种子萌发有抑制作用。