冬小麦小RNA高通量测序及生物信息学分析

东农冬麦1号是我国首例可在黑龙江高寒地区种植的强抗寒冬小麦(Triticum aestivum)品种。鉴于分蘖节的耐寒程度直接影响植株的安全越冬, 且MicroRNAs是一类生物体内普遍存在的非编码内源小分子RNA, 在植物的生长发育和适应胁迫等过程中具有重要作用, 该文基于HiSeq深度测序原理, 对5°C和–10°C胁迫下的东农冬麦1号分蘖节进行测序, 并开展生物信息学分析。结果表明, 在5°C文库中有2 229 955条特有小分子RNA序列, 并检测到35条已知miRNA, 属于30个miRNA家族, 其表达丰度介于1–173 810之间; 在–10°C文库中有3 721 449条特有小分子RNA序列, 并发现29条已知miRNA, 属于24个miRNA家族, 其表达丰度为1–105 868。靶基因预测结果表明, 5°C文库的30个miRNA家族中共预测到53个靶基因。功能分析结果显示, 这些基因主要参与转录调节、新陈代谢、胁迫响应和信号转导等过程。已知小麦miRNA的类型和表达丰度在5°C和–10°C两个文库中均有较大差异。     

萱草microRNAs生物信息学及与冷冻相关microRNAs的分析

microRNA是一类长度为16-29nt的非蛋白质编码的内源小分子RNA（sRNA）,在植物生长发育以及逆境胁迫响应等过程中发挥着重要作用。本文利用基于HiSeq原理的sRNA深度测序技术,结合生物信息学方法对萱草根系中已知miRNA的类型、丰度以及部分与冷冻胁迫相关的已知miRNA的功能进行了分析。结果表明,在10℃常温和2-5℃低温条件下萱草根系中分别有14843184和16072575条序列信息,代表14064385和15309725种sRNA片段,且sRNA均呈现正态分布特征;在非编码RNA中转运RNA（tRNA）、核糖体RNA（rRNA）所占比例较大。低温sRNA组中得到注释的sRNA有67411种,共计799994条sRNAff／段;常温NsRNA组中,得到注释的sRNA有66524种,共计1055466条sRNA片段。冷冻胁迫下,萱草通过提高miR393、miR397、miR396的表达量和降4NmiR319的表达量来增强其抗冻性。本研究为后续揭示萱草低温应答蛋白合成的调控机理,筛选抗冻关键调控基因提供了丰富的数据。     

忘萱草新品种‘红宝石’花托的离体培养与规模化生产

1植物名称忘萱草[Hemerocallis fulva（L．）L．var．disticha（Donn）Baker]红色系新品种‘红宅石’。 2材料类别花托。