糖蛋白质组学的信息学资源和方法

糖基化修饰是生物体内最常见、最重要的蛋白质翻译后修饰之一.哺乳动物体内超过50%的蛋白质都会发生糖基化修饰.糖蛋白广泛分布于各种组织的细胞膜表面,执行着重要的生物学功能.随着高通量、高灵敏度和高分辨率的蛋白质组学时代的来临,许多基于串级质谱技术解析糖链结构的生物数据库和分析软件也亦应运而生.本文综述了目前文献中最常用的糖类生物信息学资源,包括各种糖蛋白的数据库以及质谱解析糖类的相关工具和新技术、新方法.     

不同低温需求量砂梨休眠相关基因PpMADS13的特征及表达模式

为探究福建主栽的不同低温需求量砂梨Pyrus pyrifolia品种中休眠相关基因PpMADS13-1和PpMADS13-3序列及表达特征,以‘黄花’、‘蜜雪’两品种休眠时期的花芽为材料,克隆PpMADS13-1和PpMADS13-3基因,利用荧光定量PCR技术分析基因在休眠时期的表达变化情况。结果显示,PpMADS13-1序列在砂梨两品种间较保守,而PpMADS13-3序列在两品种间保守性较差;‘黄花’梨PpMADS13-1hh和PpMADS13-3hh在休眠期间随着休眠的解除下调表达,‘蜜雪’梨PpMADS13-1mx和PpMADS13-3mx在休眠期间呈现“M”型表达趋势。PpMADS13-1和PpMADS13-3均对砂梨的花芽休眠解除起到调控作用,在不同低温需求量品种间PpMADS13-1和PpMADS13-3的休眠调控模式有所不同。