樟树全基因组调查

樟树是我国特有的珍贵用材和经济树种,富含多糖多酚、萜类等次生代谢物质,是香精香料、油脂化工和医药等的重要原料树种。本研究采用高通量测序技术(Illumina HiseqTM2000)首次测定了樟树基因组大小,并利用生物信息方法估计樟树杂合率、重复序列情况和GC含量等基因组信息,为全基因组测序策略的选择提供依据。主要结论如下:(1)樟树基因组大小粗略估计为760 Mb左右;(2)樟树基因组有较高的杂合率和一定的重复,杂合率约为0.65%;(3)由于樟树杂合率较高,全基因组鸟枪法策略不适合该基因组测序分析,可尝试使用BAC-to-BAC策略或fosmid策略,有利于樟树基因组的序列拼接和组装。     

米非司酮联合桂枝茯苓胶囊治疗子宫肌瘤疗效观察

目的：探讨米非司酮联合桂枝茯苓胶囊应用于子宫肌瘤治疗的可行性及安全性。方法：76例子宫肌瘤患者随机分为两组,对照组予以米非司酮单独治疗,治疗组加入桂枝茯苓胶囊联合治疗,完成治疗后观察疗效。结果：治疗组总有效率（84．2％）显著高于对照组总有效率（71．1％）,组间差异有统计学意义（P〈0．05）;通过降低患者血生殖激素水平及改变血液流变学情况,两种治疗方法最终有效缩小子宫肌瘤体积,显著改善患者月经量增多、经期延长和贫血症状,且治疗组疗效优于对照组（P〈0．05）。结论：米非司酮联合桂枝茯苓胶囊可协同治疗子宫肌瘤,效果较好,且安全性较高。     

樟树叶绿体基因组密码子偏好性分析

为分析樟树(Cinnamomum camphora)叶绿体基因组密码子偏好性使用模式,该研究利用CodonW、EMBOSS、R语言等软件和程序,对53条樟树叶绿体基因组密码子使用模式及偏好性进行了系统分析。结果表明:樟树叶绿体基因的有效密码子数(ENC)在36.82～59.30之间,表明密码子的偏好性较弱。相对同义密码子使用度(RSCU)分析发现RSCU>1的密码子有32个,其中28个以A、U结尾,表明第3位密码子偏好使用A和U碱基。中性绘图分析发现GC₃与GC₁₂的相关性不显著,回归曲线斜率为0.049,说明密码子偏好性主要受到自然选择的影响。ENC-plot分析发现大部分基因落在曲线的下方,同样表明选择是影响密码子偏好性的主要因素。该研究发现共有9个密码子(UUU、CUU、UCA、ACA、UAU、AAU、GAU、UGA、GGA)被鉴定为樟树叶绿体基因组的最优密码子。     

木荷种源间光合作用参数分析

基于直角双曲线修正模型估算3个不同纬度的木荷种源(开平、太平和永丰种源)光补偿点、饱和点、最大净光合速率等参数,以便为评价不同木荷种源对环境的适应能力和优良种源选择等提供科学依据。结果表明:在3个不同纬度种源中,开平种源具有最高的净光合速率、最大净光合速率和较高的表观量子效率,且其生长速率最快;太平种源光饱和点最高,但其净光合速率、表观量子效率和最大净光合速率最低,其生长速率也最低;永丰种源具有较高的净光合速率、最大净光合速率和表观量子效率,其生长速率略高于太平种源。3个不同纬度木荷种源中,南部开平种源对当地环境具有较强的适应能力和生长潜力,具有较高的推广应用价值。     

樟树5种化学类型叶片转录组分析

樟树(Cinnamomum camphora )是樟科植物的一个代表种, 具有材用、药用、香料、油用和生态环境建设等多种用途。叶精油中富含利用价值极高的樟脑、芳樟醇、1,8-桉叶油素、异-橙花叔醇和右旋龙脑等萜类化合物。依据叶精油中主要成分的种类和含量, 可将樟树划分为脑樟、芳樟、油樟、异樟、龙脑樟5种化学类型。文章采用Illumina HiSeq™ 2000高通量测序技术, 对5种化学类型叶片转录组进行测序, 对测序得到的所有Unigene进行GO(Gene Ontology)、COG(Clusters of Orthologous Groups)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分类, 给出功能注释和Pathway注释, 并预测Unigene蛋白编码区(Coding sequence, CDS)。De novo组装共获得156 278个Unigene, 序列平均长度584 bp, N50(覆盖50%所有核苷酸的最大Unigene长度)为1 023 bp。通过与其他核酸、蛋白数据库的Blast搜索比对, 共有55 955条Unigene获得了基因注释, 占所有Unigene的35.80%。其中, 有24 717条Unigene得到GO注释, 有21 806条Unigene得到COG注释。KEGG pathways分析结果表明, 共有3 350条基因(10.19%)注释到次生代谢生物合成途径, 其中参与单萜、二萜、倍半萜和萜类骨架合成的Unigene有424个。在单萜合成的代谢通路中, 有9条Unigene可能编码芳樟醇合成酶基因, 且表达分析结果显示, 芳樟醇合成酶基因在芳樟化学类型中优势表达, 在油樟化学类型中表达水平较低。这些注释信息的完成为樟树功能基因及相关候选基因的发掘提供了基础数据和重要依据。     

米非司酮联合桂枝茯苓胶囊治疗子宫肌瘤疗效观察

目的:探讨米非司酮联合桂枝茯苓胶囊应用于子宫肌瘤治疗的可行性及安全性。方法:76例子宫肌瘤患者随机分为两组,对照组予以米非司酮单独治疗,治疗组加入桂枝茯苓胶囊联合治疗,完成治疗后观察疗效。结果:治疗组总有效率(84.2%)显著高于对照组总有效率(71.1%),组间差异有统计学意义(P<0.05);通过降低患者血生殖激素水平及改变血液流变学情况,两种治疗方法最终有效缩小子宫肌瘤体积,显著改善患者月经量增多、经期延长和贫血症状,且治疗组疗效优于对照组(P<0.05)。结论:米非司酮联合桂枝茯苓胶囊可协同治疗子宫肌瘤,效果较好,且安全性较高。     

樟树NBS-LRR类抗病基因家族分析与CcRNL基因克隆

樟树(Cinnamomum camphora L.Presl.)是自然界中较少受病原体侵害的优良抗性种质资源。利用生物信息的方法对樟树叶组织转录组数据中NBS类抗病基因进行了鉴定,对其编码的假定蛋白的理化性质、保守基序及系统发生关系等进行分析。结果表明,在樟树叶组织转录组中共找到28个具有完整编码框的NBS类抗病基因,大小在2 118-3 378 bp之间,编码蛋白等电点在5.35-9.03之间;在NBS区域内鉴定获得8个保守motifs,系统发育树将28个成员分为5个亚组。通过PCR法克隆获得2个RNL类抗病基因全长,分别命名为CcRNL1和CcRNL2,在氨基酸序列水平二者相似性为71%,在多肽N端都具有RPW8-like保守序列,暗示它们可能具有拟南芥RPW8基因所具有的广谱抗白粉病功能。采集感白粉病和正常樟树幼叶进行表达分析,结果显示CcRNL1可被樟树白粉病菌诱导表达,推测其可能参与了响应白粉病菌胁迫反应过程。     

子宫内膜异位症患者血清VEGF和CRP水平变化及其相关性

目的：探讨子宫内膜异位症患者血清血管内皮生长因子（VEGF）和C-反应蛋白（CRP）的水平变化及其相关性。方法：采用ELISA的方法测定30例III～Ⅳ期子宫内膜异位症患者（其中增生期13例、分泌期17例）和22例非子宫内膜异位症患者（其中增生期10例、分泌期12例）血清VEGF和CRP的水平,并分析两者相关性。结果：子宫内膜异位症组分泌期血清VEGF水平明显高于对照组（P〈0．05）;子宫内膜异位症组增生期血清CRP水平明显高于对照组（P〈0．05）;子宫内膜异位症组增生期和分泌期血清VEGF与CRP水平存在显著的正相关（F0．52,P〈0．05;r=0．44,P〈0．05）。结论：子宫内膜异位症患者血清VEGF、CRP水平的升高说明了过度血管生成和异常炎症反应是子宫内膜异位症的显著特征。