肽段的理论串联质谱图预测方法研究进展

基于串联质谱技术的蛋白质组学已经成为生命科学领域的重要工具,其中肽段的理论串联质谱图(通常也被称为二级谱图)预测问题在近年来广受关注.大量高质量质谱数据的积累和计算技术的发展为此问题的解决提供了有效途径.肽段的理论二级谱图预测的方法可以分为两大类,一类是基于物理模型的方法,即基于移动质子模型的方法,例如MassAnalyzer、MS-Simulator;另一类是基于机器学习的方法,包括集成学习相关算法和基于神经网络的方法,例如PeptideART、MS2PIP、MS2PBPI和p Deep等.本文对这两大类方法进行了整理和综述,并简要指出了目前理论谱图预测方法存在的一些不足,展望了未来的发展方向.     

OPN联合CA125检测在卵巢癌早期诊断中的价值

目的:观察骨桥蛋白(OPN)和癌抗原125 (CA125)联合检测在卵巢癌早期诊断中的价值.方法:采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定32例卵巢癌患者(A组)及40例卵巢良性病变(B组)血清中ONP、CA125水平.结果:卵巢癌患者血清中OPN及CA125水平明显高于良性对照组(P＜0.05);OPN、CA125检测的敏感性分别为81.3％和71.9％,OPN+CA125联合检测的敏感性为93.8％,均高于二者的单独检测;OPN、CA125检测的特异性分别为92.5％和87.5％,OPN+CA125联合检测的敏感性为95.0％,均高于二者的单项检测;OPN+CA125联合检测的阳性预测值和阴性预测值均高于二者的单项检测.结论:OPN联合CA125联合检测可提高卵巢癌的早期诊断水平.     

基于VOSviewer和CiteSpace的昆虫肠道微生物领域可视化分析

【背景】近年来，昆虫肠道微生物领域受到科研工作者的广泛关注，相应发表了大量的科研论文和著作。然而目前尚缺乏对昆虫肠道微生物全面、系统的文献计量分析。【目的】了解国内外昆虫肠道微生物领域的历史、研究热点和新兴趋势。【方法】以昆虫肠道微生物为搜索主题对中国知网(China National Knowledge Infrastructure, CNKI)数据库和Web of Science (WOS)数据库进行检索，利用文献计量工具VOSviewer和Cite Space对关键词进行分析。【结果】1991-2022年间该领域全球研究发文量整体呈现上升趋势，国内外对昆虫肠道微生物领域的关注点和研究方向逐渐扩大。关键词聚类锚定了3个新兴研究领域：昆虫饮食(insect meal)、次生代谢物(secondary metabolites)和生物降解(biodegradation)。【结论】基于文献计量学研究的发现提供了昆虫肠道微生物领域的现状和趋势，可能有助于确定该领域的热点话题和探索新的方向。