深海放线菌08A4的鉴定及其抗真菌活性产物研究

从南海深海分离得到1株放线菌08A4,其发酵产物具有抗植物病原真菌活性,分离纯化得到3个化合物,通过1H-NMR初步鉴定为抗霉素类物质。结合形态学鉴定方法与16S rDNA序列分析方法,鉴定该菌株为微白黄链霉菌(Streptomyces albidoflavus)。     

培养调控激活卡伍尔氏链霉菌NA4产frontalamides类物质的研究

微生物(尤其是链霉菌)是农用抗生素的主要来源之一。前期基因筛选发现卡沃尔氏链霉菌NA4具有产生多种PKS和NRPS类型化合物的潜能,但只分离到PKS I型的抗植物病原真菌的物质bafilomycins,为了挖掘更多的抗真菌先导化合物,采用Hiseq2500高通量测序技术获得其基因组扫描图,经生物信息学分析和文献检索发现,其除了能产生bafilomycins,还具有产生polycyclic tetramate macrolactam(PTM)、alkylresorcinol和valinomycin类型抗真菌活性物质的潜力。为了激活这些基因簇,采用基于OSMAC策略中的培养调控为手段,通过改变培养基碳氮源组分,添加氨基酸前体及不同金属离子,使用活性追踪和HPLC-UV发现用麸皮替代NM2培养基中甘油的培养条件能激活PTM类型frontalamides合成基因簇,经LC-MS分析有7个主要的化合物是PTM类化合物,其中的3个可能为新化合物。通过培养调控激活了PTM基因簇,为新型PTM类化合物进一步的分离鉴定提供参考。