从线粒体控制区全序列变异看短颌鲚和湖鲚的物种有效性

经克隆测序获得我国七丝鲚（Coilia grayii）、凤鲚（Cmystus）、刀鲚（C.nasus）和短颌鲚（C.brachygnathus）以及太湖湖鲚（C.nasus taihuensis）等4个种和1亚种32尾个体的mtDNAD．100pN全序列，以日本鲲（Engraulisjaponicus）和秘鲁鳗（E．ringens）为外类群构建了中国鲚属的分子系统发育树，并讨论了短颌鲚和湖鲚的物种有效性。结果显示，七丝鲚的D-loop区全序列长1，208bp，凤鲚1，279-1，361bp，刀鲚1，252-1，290bp，短颌鲚1，214-1，252bp，湖鲚1,252-1，442bp，除七丝鲚外的其他种类个体问均表现出序列长度的多态性。短颌鲚、刀鲚和湖鲚三者问的平均K2．P遗传距离仅为0．011-10．020，明显小于它们与风鲚、七丝鲚及外类群问的遗传距离（0．051-0．349）。以邻接法和最大简约法构建的系统发育树表明，刀鲚、短颌鲚及湖鲚均未各自构成单系，而是共同构成一个单系群，三者并未发生显著分化。研究表明，短颌鲚和湖鲚为刀鲚的淡水生态型种群，并非有效物种。系统发育分析表明，中国鲚属3个有效物种问以风鲚最为原始，刀鲚和七丝鲚为姐妹群，处于较进化的位置。推测风鲚可能是鲚属祖先种最早从起源中心扩散到西北太平洋的后裔，而刀鲚和七丝鲚则是凤鲚在演化过程中分别适应寒冷和温暖气候而分化出的物种。  

中国鲚属鱼类的矢耳石形态特征

分析了205尾分布于中国的4种2龄鲚属鱼类的矢耳石形态特征。结果显示,这4种鱼类的矢耳石都具有翼叶和基叶,但无后基叶和副基叶,中央突也不明显。背侧有脊突,叶形晶状突呈小三角形,仅限于腹侧。主凹槽明显,直管状,后端封闭。4种鱼矢耳石长轴长为体长的1.68%~2.82%,矢耳石重为体重的0.26‰~1.71‰;不论绝对重量或面积,均以七丝鲚和凤鲚的最大,刀鲚的次之,短颌鲚的最小,显现出与在海水中生活的时间呈正相关性。刀鲚和短颌鲚的矢耳石较轻薄,单位面积均重1.22~1.40mg/mm2;七丝鲚和凤鲚的较厚重,单位面积均重约1.86mg/mm2。矢耳石的长轴、短轴和单位重量等的变异系数,均要小于其体长特别是体重的变异系数,矢耳石形态的稳定性显著优于其身体形态的稳定性。  

长江口邻近水域刀鲚的线粒体控制区序列变异与遗传多样性

经克隆测序获得了采自长江口九段沙、钱塘江口、舟山等3个地点35尾刀鲚(Coilia nasus)的mtDNA控制区全序列,分析了控制区序列的变异和遗传结构。结果显示,长江口邻近水域刀鲚的mtDNA控制区序列具有长度多态性,全长为1214~1291bp,主要是在第358位点处有以"CTA TGT ATT ATA TTA CAT ATA TTA TGG TAT AGT ACA TA"38bp为单位的1~2次片段重复。种群遗传结构分析显示,长江口邻近水域刀鲚的平均单倍型多样性(h)为0.9983,3个群体的平均核苷酸多样性(π)为0.0262,表现出丰富的遗传多样性和较高的进化潜力。3个刀鲚群体间的分化指数FST仅为0.012~0.053,而基因交流值Nm却达9.90~40.62。群体间K2-P遗传距离与AMOVA分析结果也表明,长江口及毗邻地区的刀鲚没有发生地理分化。以线粒体DNA控制区全序列构建的NJ树揭示,3个群体的个体组成了2个谱系,但这2个谱系与地理分群并不相关。依据分子钟理论,推测这两个谱系的分化发生在更新世末期。  

基于矢耳石形态特征的中国鲚属鱼类种类识别

分析了中国鲚属鱼类七丝鲚、凤鲚、刀鲚和短颌鲚共4种205尾2龄鱼矢耳石的32个形态特征。对9个可量性状的主成分分析表明,反映矢耳石体积和基叶大小的第1主成分,以及与反映翼叶大小的第2主成分共同解释了总变异的91.2%,是种类判别的主要依据。对10个比例性状的逐步判别显示,4个种的平均正判率达95.6%,但交互验证结果却显示,刀鲚与短颌鲚间存在着20.1%的误判率,表现出与传统的依据外部形态分类和线粒体DNA控制区全序列分析的相似结果。这表明,短颌鲚并非有效种,而是刀鲚的淡水生态型种群,也预示着耳石形态分析在近缘种判别方面的良好应用前景。  

基于线粒体控制区的序列变异分析中国东南部沿海凤鲚种群遗传结构

为了解中国东南部沿海凤鲚(Coilia mystus)的种群遗传多样性和遗传结构, 本文分析了长江口(CJ)、钱塘江口(QT)、闽江口(MJ)和九龙江口(JL)4个凤鲚地理群体的mtDNA控制区561 bp片段的序列变异。65尾样本共检测到28个单元型。4个群体总的单元型多样性和核苷酸多样性均较高(h = 0.9433 ± 0.0168, π = 0.0317 ± 0.0158), 但单个群体的核苷酸多样性水平却很低, 其中以CJ最高(π = 0.0080 ± 0.0046), MJ最低(π = 0.0015 ± 0.0013)。MJ与JL群体之间以及CJ与QT群体之间的平均K2P遗传距离很小, 分别为0.3%和0.8%; 而CJ、QT分别与MJ、JL群体之间的遗传距离均较大, 达到了6%。采用最大似然法(ML)、最大简约法(MP)和邻接法(NJ)分别构建的单元型间的系统发育树揭示, 4个凤鲚群体构成CJ-QT 和MJ-JL 2个支系, 且具有极高的支持率。单元型的网络分析也显示这两个支系间有高达28步的突变次数。AMOVA分析显示大部分的遗传变异来自这两支系群体间(90.77%), 表明凤鲚群体间存在着显著的地理分化。种群分化指数和基因流分析也表明, 支系间群体有着明显的遗传分化(F_ST > 0.9, N_m < 0.03)。所有分析结果支持所研究的凤鲚标本属于两个不同的地理种群, 且种群的分化至少已达到亚种水平。采用BEAST和TRACER软件得到凤鲚两个亚种的最近共同祖先约在0.34–0.46百万年前, 处于更新世晚期, 推测可能是第四纪晚期的气候旋回和海平面的升降导致了凤鲚的种群分化。  

长江刀鲚不同生态型间的某些形态差异

为寻找和检验长江刀鲚(Coilia nasus)不同生态型间的形态差异,分析了江苏靖江、上海九段沙、浙江太湖和江西鄱阳湖4个种群906尾样本的脊椎骨数、臀鳍条数和上颌骨长。结果表明,即使是同一种群内的脊椎骨数和臀鳍条数变幅也较大,但均以靖江和九段沙种群的较多,众数分别为81、80和108、109;太湖和鄱阳湖种群的较少,分别为77、75和100、98。上颌骨长/头长也以靖江和九段沙种群的较大,均值为1.067和1.063;太湖和鄱阳湖种群则分别为1.014及0.831。单因素方差分析表明,除了靖江与九段沙种群之间,其他种群间的脊椎骨数和上颌骨长/头长的平均值均有显著或极显著差异;而臀鳍条数均不具有显著的种群差异。洄游型(包含靖江和九段沙)、太湖和鄱阳湖种群的Bayes判别成功率分别达92.9%、92.8%及99.5%,表明现有研究虽已认同短颌鲚(C.brachygnathus)和湖鲚(C.nasustaihuensis)同属于刀鲚,但三者之间还可以依据某些形态特征的组合进行区分。  

鱼类嗅觉器官的形态与生理研究进展

对鱼类嗅觉器官的发生、宏观和微观形态结构、嗅觉生理等方面的研究进行了综述;并指出,依据鱼类嗅觉器官开展系统进化方面的研究,以及基于嗅觉分子生理机制而开展的有关行为学方面的研究,可能是未来鱼类嗅觉器官的重要研究方向。  

广西十万大山地区的鱼类资源现状和保护对策

位于广西西南部的十万大山地区鱼类物种多样性丰富，分布于十万大山的野生鱼类以小型或中小型为主，缺乏经济价值高，产量大的种类，这是该地区野生鱼类资源的主要特点，目前资源量和鱼类物种丰富度都呈现出明显下降的趋势。这主要同有害的渔业生产方式和过密的捕捞强度，小水利设施及外来种的入侵有关。加强宣传力度和强化渔政管理，开发其它副业，拆除废弃的小水利工程，对人工养殖鱼种加强管理，以及开展入侵种对土著种影响的科学研究等是保护这一地区鱼类多样性的重要手段。  

长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼种群遗传结构及种群历史分析

应用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术及细胞色素b（Cytｂ）基因序列，分析了长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼（Boleophthalmus pecinirostris）群体遗传结构及种群历史，结果显示这一区域大弹涂鱼群体的遗传多样性水平很高。（1）RAPD分析结果：从100个10碱基随机引物中筛选出30个多态性引物，对长江口九段沙湿地、浙江舟山定海、福建霞浦群体各20个体进行RAPD分析，3个群体分别获得236、270、274条带，共301个有效位点。3群体多态位点比例（P）、Nei基因多样性指数（H）、Shannon多样性指数（I）分别在93.02%—96.35%、0.3890—0.4219、0.5618—0.6044。分子方差分析（AMOVA）表明，大弹涂鱼群体间存在显著的遗传分化（Fst= 0.03004-0.03254，P<0.05），但仅3.2%的遗传变异来自群体间。（2）Cytｂ基因序列分析结果：从采自九段沙、定海、霞浦及浙江慈溪的42尾大弹涂鱼样本中，共获得33个Cytｂ基因单倍型（序列长1 141 bp）。4群体的平均单倍型多样性（h）、核甘酸多样性（π）分别为0.9814、0.0048。4群体间的遗传分化指数Fst为0.00043—0.07814，仅1.93%的变异来自群体间（AMOVA分析），而基因交流值却达14.50—30.79，群体间K2-P遗传距离为0.0040—0.0056，从而显示大弹涂鱼群体间没有发生明显的地理分化。以Cyt b基因序列构建的NJ树揭示4个群体的个体组成2个谱系，但这2个谱系与地理分布并不相关。中性检验、错配分析和网络亲缘关系分析皆表明大弹涂鱼群体有过种群扩张，扩张时间约在更新世末期的0.057—0.023百万年前。  

长江河口区江豚种群调查

为弄清长江河口区江豚(Neophocaena asiaeorientalis)种群数量和分布情况,于2012年6月8~11日和2012年9月12~19日对这一水域作了2次较大覆盖面的目视考察和9次遗骸搜寻。6月的考察目击到江豚5群8头,9月的考察未目击江豚个体。依据样带法估算,长江河口水域6月份的江豚种群数量约为61头。全年共获得7头江豚遗骸,并搜集到其他5例死亡信息。对其中5头外表完整、特征保留良好的遗骸所作的鉴定结果显示,2头为长江亚种(N.asiaeorientalis asiaeorientalis),3头为东亚亚种(N.asiaeorientalis sunameri)。调查表明,崇明岛西端和青草沙附近水域是长江亚种活动的热点水域,可作为重点监护区域。