快速STR分型在法医DNA分析中的应用研究进展

STR分型是目前世界通用的DNA指纹分析方法.传统的分型方法包括DNA提取、DNA定量、PCR扩增和对扩增后的STR片段进行检测和分析,耗时较长(8¹0 h).一些情况下很难满足案件的实际需求.法医学家们在加快STR分型的方法研究一直不懈努力.现从快速提取DNA、无提取直接PCR、快速PCR、微流控芯片技术在STR快速分型方面的应用四方面,对近年来出现的可进行快速STR分型的新技术、新方法进行综述.     

4种快速PCR检测试剂法医学应用的初步研究

采用快速PCR扩增,探索其法医学应用价值.将AmpFLSTRIdentifiler试剂盒分别与4种不同的快速PCR检测试剂联合构建快速PCR体系,以9947A为模板,采用各自优化的循环参数进行扩增,并将各分型结果与常规方法进行比较,结果表明:联合构建的4种快速PCR体系均可获得与常规方法一致的DNA分型结果,扩增用时最短可减少至22 min.可见应用快速PCR方法进行扩增,可获得与常规方法一致的STR分型,并且显著缩短扩增时间,提高DNA分型速率.     

微流控芯片电泳及其法医学应用

在光学性能良好的Brofloat玻璃电泳芯片上,利用自行搭建的共聚焦激光诱导荧光检测系统,通过对芯片管道表面修饰、筛分介质、分离电场强度、进样方式、电泳温度、进样时间等条件的优化,对含15个STR基因座的法医DNA样品进行电泳分离测试实验.通过对芯片电泳条件优化获得了本电泳系统的最佳条件,成功实现8 min内完成DNA样品片段的分离,表明该微流控芯片电泳系统在法医DNA快速分析方面具有良好的应用前景.     

31例非获得性免疫缺陷综合征肺隐球菌病临床分析

目的通过研究非获得性免疫缺陷综合征肺隐球菌病的临床特点,提高医务人员对肺隐球菌病的认识,做到早期诊断和治疗。方法回顾性分析2001年1月至2011年12月在南京医科大学附属杭州市第一人民医院确诊的31例非获得性免疫缺陷综合征肺隐球菌病患者的性别、年龄分布、职业情况、伴随的基础疾病、临床症状、实验室检查、影像学特征、治疗方案及预后等各方面特点。结果肺隐球菌病发病年龄有年轻化趋势,临床特点及影像学表现缺乏特异性,极易误诊及漏诊。治疗方法及药物少,病程长。结论肺隐球菌病虽然临床表现缺乏特异性,但从病例分析结果来看诊治该病仍有一定规律可循,亟需提高对本病的认识,遇到疑似病例应行血乳胶凝集试验及肺活检或手术病理予以明确,药物治疗需要足够疗程。     

DNA探针在法医学中的应用研究——Ⅰ.用PYNH24探针作个体识别和家系分析

应用PYNH24特异性DNA探针,分析了人体基因组DNA MspⅠ酶的RFLPs,获得清晰易读的图谱。190名不相关个体中,多态性为95％,在8个家系45名相关个体中,等位基因的遗传特征完全符合孟德尔定律,为法医生物物证检验工作增加了一种新的分析方法。     

微流控芯片技术用于精子与上皮细胞分离的研究

为研究建立使用微流控芯片技术分离精子与阴道上皮细胞的方法,选用制作工艺简单的玻璃-PDMS芯片,对混合样本进行分离。加样前分别在进、出口池中加入7此和lO此缓冲液,然后在进样口加入2此混合样本。至少静置8nlin后,从出口池中取出3此形成重力驱动的微流体后开始分离,每隔5min在进样口补加1此缓冲液。达到理想分离效果时,用移液器从出口池取出分离出的精子,核酸酶去除游离DNA,经过提取、扩增和电泳分离脸测等步骤得到精子的分型结果。结果显示,使用基于重力驱动微流体原理的微流控芯片可在30min内分离出精子,不会有上皮细胞进入分离通道;通过核酸酶对分离出的精子液的去游DNA处理,可得到单一、完整的精子分型。与传统的差异裂解法相比,这种方法在很大程度上节省了检验时间,在性侵案件中具有一定的法医物证分析价值。     

植物病毒资源属性和应用基础研究进展

病毒作为地球上最简单的生命形式,通过感染人、动物和植物等寄主产生传染性疾病。与其他微生物相比,病毒具有基因组小、复制量大、遗传操作简单等特点,具有很强的生物资源属性。过去几十年,对植物病毒的研究主要集中于解析其致病机制、植物的抗性机制及如何防控植物病害。但是随着研究的深入及概念的革新,人们发现植物病毒还具有很强的生物资源属性。随着分子生物学以及基因组、转录组、蛋白组学等技术的发展,越来越多的植物病毒被发现、改造和利用。本综述着重围绕植物病毒的资源属性与病毒载体的改造利用及其在生物工程方面的应用等最新研究进展,讨论其广泛的应用前景,挖掘其资源化的潜力。     

c-Myc功能及其下游靶点

c-Myc是一个在进化上较为保守的,具有b/HLH/LZ结构的转录调节因子,它可以与Max形成异源二聚体通过结合于启动子区的E盒结构对基因进行转录激活调控,也可以通过其他方式对基因进行正负调节,参与调控了细胞的增殖、分化、生长、凋亡、细胞周期进程、细胞内生物大分子的代谢以及细胞的恶性转化。近期,研究者通过采用微阵列芯片、生物信息学技术、染色质免疫沉淀(ChIP)、基因表达系列分析(SAGE)等高通量研究的新技术对c-Myc下游靶点进行研究,这对于揭示c-Myc结构与功能之间的关系具有重要的生物学意义。     

中国南北方汉族人群DNA甲基化表观遗传差异研究

目的 族群地域、体貌特征等表型是基因型与环境共同作用的结果。大量基因组学研究表明,汉族人群具有混合特征,内部存在明显的南北遗传差异。本研究旨在探索研究表观基因组在中国南北方汉族人群之间是否存在差异,并筛选差异遗传位点。方法 使用GLINT软件对483份汉族样本的全基因组甲基化芯片数据进行EWAS分析,使用Lasso回归方法筛选位点。使用多元逻辑回归算法构建南北方汉族人群预测模型,通过十折交叉验证的方法评估。结果 筛选出一组南北方汉族之间差异显著的CpG位点,准确性为99.03%,Kappa系数为0.979 6。结论 本研究表明南北方汉族人群之间存在表观遗传差异,本研究为进一步开展不同地域汉族人群之间的表观遗传差异研究奠定了基础。