基于进化信息改进蛋白质定点突变稳定性预测准确率

定点突变后蛋白质稳定性的增加还是降低,是分子生物学和蛋白质工程的核心问题之一,也是目前生物信息学研究的重要领域。基于蛋白质序列信息对蛋白质定点突变后的稳定性进行预测的方法,因其简易、适用面广而得到广泛的研究应用。通过对编码策略（coding schemes）的探索,发现不同编码策略对预测准确率有较大影响,并发现基于进化信息的BLOSUM打分矩阵可以用于蛋白质定点突变稳定性预测,具有较高的预测准确率。应用基于BLOSUM62打分矩阵的神经网络（ANN）和支持向量机（SVM）算法,可以改进蛋白质定点突变后稳定性的预测,而且ANN+ BLOSUM62在1623条序列的数据集上的实测结果优于目前国际通用的几款预测 软件。     

抗纤维蛋白β链N端七肽抗体的制备

编码纤维蛋白β链Ｎ末端七肽（β七肽）的寡核苷酸片段,通过基因重组技术插入到金葡核酸酶（Ｐ－１蛋白）基因的５′端。在Ｐ_ＲＰ_Ｌ启动子的调控下,β七肽以融合蛋白（β七肽·Ｐ－１）的形式在Ｅ．ｃｏｌｆｉ细胞中得到高效表达。以纯化的融合蛋白为免疫原,制备出抗β七肽抗体;纤维蛋白原（ＦＧ,４ｇ／Ｌ抑制实验证明,该抗体对纤维蛋白（ＦＰ）有特异性反应。     

人R_O蛋白(60kD)编码序列的PCR产物在E.coli中的克隆与表达

通过聚合酶链反应 ( PCR)自人脾 c DNA扩增 RO 蛋白 ( 60 k D)编码 DNA片段 .将该片段定向插入麦芽糖结合蛋白 ( MBP)融合系统的 p MALTM- c载体中并转化 E.coli ( DH5α) ,通过酶联免疫印迹 ( IBT)筛选出具有 RO 抗原性的阳性克隆 .绝大部分阳性克隆表达完整的 RO 融合蛋白 ( 1 0 0k D) .但在传代过程中表达水平很快降低 ;少数阳性克隆虽然表达非完整 RO 融合蛋白 (分子量 <80k D) ,但表达水平却高而且稳定 .同时保留了很强的 RO 抗原性 .产生非完整融合蛋白的一个原因是 ,PCR碱基错配引起 RO 编码 DNA的序列缺失 ;另一原因是融合蛋白在表达过程中被降解     

银染法在猪脾可提取性核抗原的小核RNA分析中的应用

可提取性核抗原(extractable nuclear antigens,ENA)是哺乳动物细胞核的生理盐水抽提物,它包括Sm、RNP、La(SS-B)和Ro(SS-A)等四种主要抗原成分。它们是由核内核糖核酸和蛋白质组成的复合物(snRNPs),其核糖核酸组分属于核内小RNA类,称为snRNAs。近几年来,小核RNA的研究愈来愈受到广泛重视。但是,由于含量极少,给分析带来困难。     

TTC—脱氢酶活性测定法的改进

以紫色非硫光合细菌、枯草芽孢杆菌为材料,改进了ＴＴＣ－脱氢酶活性的测定方法,在该法中样品不需处理,在常温下用三氯甲烷代替丙酮萃取,液－液分层效果好,显色稳定但不褪色。对测定中的诸多影响因素也作了研究。确定了改进后的脱氢酶活性测定的最佳条件。     

TTC－脱氢酶活性测定法的改进

以紫色非硫光合细菌、枯草芽孢杆菌为材料,改进了ＴＴＣ脱氢酶活性的测定方法。在该法中样品不需处理,在常温下用三氯甲烷代替丙酮萃取,液－液分层效果好,显色稳定但不褪色。对测定中的诸多影响因素也作了研究,确定了改进后的脱氢酶活性测定的最佳条件。     

Ro、La的组成和相互关系

本文证明,猪脾Ro和La不仅分布在细胞质中,也存在于细胞核内。Ro的抗原性多肽为60kD,La为45—47kD(二条)、26—29kD(三条)、Ro和La在细胞质中以复合形式存在,而在细胞核内则相互独立。     

碱裂解提取质粒DNA的改进

碱裂解提取质粒DNA是分子生物学实验中常用的方法,但通常方法所提取的质粒往往含有大量的RNA和其他杂质.本文适时加入较高浓度的RNA酶和适当延长冰浴时间,结果得到了几乎没有RNA和其他杂质的高纯质粒DNA,不仅达到了分子生物学实验要求,而且可用作抗原检测抗dsDNA抗体.该法操作简单、经济、实用.     

金属螯合亲和层析纯化和复性重组人铜锌超氧化物歧化酶

将重组人铜锌超氧化物歧化酶（rhCu,ZnSOD）包含体（经纯化后纯度达80％以上）以稀释法或透析法初步复性后,分别再经金属螯合亲和层析（MCAC）纯化。结果透析复性样品和稀释复性样品经MCAC纯化后的rhSOD比活是各自上柱前样品比活的2.2倍和5.3倍,蛋白回收率分别为64％和25％,同时两者活性回收率皆大于130％。表明目标蛋白rhSOD在经过MCAC纯化的同时又获得进一步复性。SDS-PAGE显示rhSOD为19kD的单一条带,纯度大于95％,比活达到5000 u/mg左右,同时NBT生物活性染色鉴定显示出很强的超氧化物歧化酶活性。表明MCAC对于复性不完全的rhCu,ZnSOD而言是一种纯化和使其进一步复性的简便省时且有效的方法。该方法为以包含体形式表达的基因重组蛋白的纯化和复性提供了新思路。     

金属螫合亲和层析纯化和复性重组人铜锌超氧化物歧化酶

将重组人铜锌超氧化物歧化酶（rhCu,Zn-SOD）包含体（经纯化后纯度达80％以上）以稀释法或透析法初步复性后,分别再经金属螯合亲和层析（MCAC）纯化。结果透析复性样品和稀释复性样品经MCAC纯化后的rhSOD比活是各自上柱前样品比活的2．2倍和5．3倍,蛋白回收率分别为64％和25％,同时两者活性回收率皆大于130％。表明目标蛋白rhSOD在经过MCAC纯化的同时又获得进一步复性。SDS-PAGE显示rhSOD为19kD的单一条带,纯度大于95％,比活达到5000u／mg左右,同时NBT生物活性染色鉴定显示出很强的超氧化物歧化酶活性。表明MCAC对于复性不完全的rhCu,Zn-SOD而言是一种纯化和使其进一步复性的简便省时且有效的方法。该方法为以包含体形式表达的基因重组蛋白的纯化和复性提供了新思路。