2012‒2013年浙江省手足口病流行病学和病原学特征分析

摘要：目的 了解2012?2013年浙江省手足口病流行特征和病原构成,为手足口病防控工作提供参考。方法 收集2012?2013年浙江省手足口病疑似患者粪便、咽拭子、疱疹液标本,采用实时荧光RT-PCR对收集样本进行HFMD病原体检测。结果 2012?2013年共采集样本1 792例,患者以5岁以下散居儿童为主;浙江省手足口病发病高峰期在5~6月份,9月份出现发病次高峰;肠道病毒总检出率为72.9%,其中2012年浙江省手足口病优势病原体为EV71（40.3%）,其次为CoxA16（31.3%）,2013年浙江省手足口病优势病原体为其他肠道病毒（77.2%） （非EV71和CoxA16）,以CoxA6为主（51.3%）。不同样本类型中,肠道病毒检出率依次为疱疹液（100.0%）、粪便（76.2%）和咽拭子（65.1%）。结论 手足口病的流行具有季节性和人群性,不同年份引起手足口病的优势病原体存在变化,持续地病原监测有助于预防和控制手足口病的流行暴发。     

2010‒2013年杭州地区甲型流感H3N2分子流行病学分析

摘要: 目的 对2010?2013年杭州地区甲型流感H3N2进行分子流行病学调查分析。方法 收集2010至2013年杭州地区H3N2监测样本数据,对样本数据按年份、性别以及年龄进行分组,比较各组之间的差异。查询、整理GenBank中的中国H3N2序列并建立数据集,并对国内H3N2的HA基因及2010?2013年杭州地区H3N2病毒HA、NA序列进行系统生物进化分析。结果 2010?2013年杭州地区H3N2感染率分析,不同年度间H3N2感染率差异具有统计学意义（χ2=14.004,P<0.05）,不同性别和年龄组间差异无统计学意义（χ2=3.552,χ2=2.691,P>0.05）。杭州地区2010年与2012、2013年H3N2感染病毒株,在系统进化树上分布存在两个不同分支,且HA序列进化属于广东省H3N2进化的不同时间点的两个分支,在国内H3N2系统进化树上存在一类未见人类感染的病毒分支。结论 H3N2感染无性别选择性及年龄差异,不同年度的感染率存在差异;杭州及我国多省市流行的H3N2感染存在广泛迁徙的现象,今后仍然具有引起高致病性大规模流行的能力,因此应加强各地监测及信息共享,做到早发现和及时防控。 关键词：甲型流感H3N2;流行病学;系统进化分析     

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分型及流行现状

【目的】研究杭州地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)的基因型别,探讨MRSA菌株流行变化趋势及进化特点,为该地区MRSA的进一步防治提供科学依据。【方法】对86株MRSA进行葡萄球菌盒式染色体SCCmec基因、spa基因分型,并开展多位点序列分型(Multi-locus sequence typing,MLST),与国际上MRSA的流行型别进行比较,分析进化关系。【结果】86株MRSA共发现13个spa型(以t311型为主,占48.8%;其次为t6418型,占11.6%);MLST分型共发现9个ST型(以ST5为主,占59.3%;其次为ST239,占16.3%),经e BURST软件分析它们属于4个群(Group 1、Group 6、Group 8、Group 12)和8种克隆复合体(CC1、CC5、CC630、CC20、CC59、CC88、CC239、CC573);SCCmec基因分型以SCCmecⅡ型为主,占61.6%;其次为SCCmec III型,占22%;5株社区相关性MRSA(SCCmec-Ⅳ型)。其中第一流行克隆型为SCCmec-Ⅱ-ST5-t311-CC5(占47.7%)、其次为SCCmec-III-ST239-t030/t037-CC239(占12.8%)。【结论】SCCmec-Ⅱ-ST5-t311为杭州地区当前流行菌株;CA-MRSA菌株的出现,提示MRSA菌株有由医院向社区播散的趋势;此外,对新发展了单位点变体的菌株(SCCmec-Ⅰ-ST1921-t164-CC20和SCCmec-Ⅳ-ST965-t062-CC5),应加强重视。     

江浙沪地区乙肝病毒B、C基因型S基因突变及选择压力分析

目的系统分析江浙沪三地的乙肝病毒B、C基因型S基因突变和选择压力情况,以期为乙型肝炎的防治提供理论依据。方法采用NCBI数据库提供的乙肝病毒序列,分为B、C基因型两组,分析突变情况,同时采用Datamonkey进行选择压力分析和Bioedit进行氨基酸置换熵值分析。结果S基因226个氨基酸位点突变分析中,产生突变有位点122个,位点突变率C基因型(45.58%)高于B基因型(30.09%)(χ~2=11.523,P=0.001);总突变率C基因型(1.36%)高于B基因型(0.80%)(χ~2=46.642,P=0.000);α决定簇突变率C基因型(2.40%)高于B基因型(0.96%)(χ~2=20.524,P=0.000)。B基因型α决定簇突变率高于总突变率(χ~2=0.735,P=0.391);C基因型α决定簇突变率高于总突变率(χ~2=44.467,P=0.000)。B基因型氨基酸突变最多的位点为200、213、161和21位点,C基因型氨基酸突变最多的位点为126、68、3、53和194位点。两个基因型dN/dS均值均小于1。B基因型没有发现正向选择位点,发现8个负向选择位点。C基因型发现7个正向选择位点,17个负向选择位点。B基因型仅发现一个易突变位点(200位),C基因型也仅发现一个易突变位点(126位),大多数氨基酸位点熵值0.4。结论江浙沪地区S基因突变率水平较低,其中C基因型位点突变率、α决定簇突变率和总突变率高于B基因型,α决定簇突变率高于总突变率。C基因型经历外界环境免疫选择压力和自身进化压力双重影响,自身进化压力强于外界环境免疫选择压力;而B基因型主要遭受自身进化压力。尤其要格外关注C基因型的进化进程。     

浙江地区妇女人乳头瘤病毒感染型别及年龄分布现状

目的调查浙江地区妇女人乳头瘤病毒(HPV)的感染现状及型别分布情况,为该地区HPV防治提供流行病学依据。方法采用流式荧光杂交法对浙江地区8 630例妇科门诊妇女的宫颈细胞标本进行27种HPV亚型的基因分型检测,不同年龄组HPV感染率比较采用卡方检验。结果 8 630例受检者中,HPV感染2 125例,感染率为24.62%。27种HPV亚型中,感染率前3位为HPV-52、16、58。54岁和17~24岁年龄组HPV感染率最高,与其他年龄组比较差异有统计学意义。结论不同年龄段HPV感染率差异有统计学意义,54岁和17~24岁年龄组为感染的高危人群;不同年龄段的HPV优势感染型别具有一定的差异性。     

苏浙闽地区婴幼儿急性腹泻患者病毒检测及 临床特征分析

目的分析苏浙闽地区婴幼儿急性腹泻患者常见病毒及患儿临床特征,为婴幼儿急性腹泻的流行病学研究和临床治疗提供参考。方法选取2010至2014年苏浙闽地区多家医院门诊就诊的急性腹泻患儿1 452例,采用ELISA法检测A组轮状病毒(HRV),多重PCR法检测诺如病毒(NoV)、肠道腺病毒(EAdV)和星状病毒(HAstV),并用RT-PCR法对A组轮状病毒阳性的样本进行G和P分型。结果 1 452例患儿中由常见病毒引起的急性腹泻患儿有707例,占总调查患者的48.69%。急性腹泻患儿常见病毒感染中单一病毒感染占90.10%(637/707),其感染病毒的构成以轮状病毒最多(47.52%,336/707),其次为诺如病毒(36.07%,255/707)以及星状病毒(2.40%,17/707)和肠道腺病毒(4.10%,29/707)。病毒感染腹泻患儿中多重感染者共70例,占9.90%(70/707),以A组轮状病毒合并诺如病毒感染最为常见,占多重感染者的68.57%(48/70)。226份A组轮状病毒阳性标本中,G分型以G1为优势分型,占33.19%;P分型中则以P [11]比例最高,占38.50%;G、P型组合以P [11]G11为主(38.50%)。结论 A组轮状病毒是引发婴幼儿急性腹泻的主要病毒,诺如病毒次之,且婴幼儿病毒性腹泻患者可合并多种病毒感染。不同地区腹泻患儿病毒感染阳性率有差异,轮状病毒基因型表现则具有多样性。     

2007-2014年肿瘤患者分离肺炎克雷伯杆菌的分布特征及耐药性变迁

目的分析肿瘤医院患者中分离的肺炎克雷伯杆菌耐药性,为感染肺炎克雷伯杆菌的肿瘤患者的治疗提供依据。方法采用WHONET 5.6软件回顾性分析肿瘤专科医院2007-2014年间肺炎克雷伯杆菌的检出率及耐药性。并按标本来源作进一步的耐药分析。结果在2007-2014年的标本中肺炎克雷伯杆菌共分离出3 665株,其中痰液标本中分离出2 230株。痰液标本和非痰液标本的科室分布都以放疗病房最多。肺炎克雷伯杆菌对奈替米星、替加环素最敏感,对氨苄西林耐药率极高,八年中,头孢菌素类抗生素和复方新诺明在2009年耐药性达到最高,后逐渐下降,喹诺酮类及碳青霉烯类药物耐药率有一定波动,但总体较好。痰液标本和非痰液标本的肺炎克雷伯杆菌的耐药性之间的差异具有统计学意义。结论肿瘤患者肺炎克雷伯杆菌引起的感染耐药性较综合性医院低;放、化疗患者由于多种原因呼吸道更易被肺炎克雷伯杆菌感染;及时监控和掌握肿瘤患者痰液中肺炎克雷伯的耐药特点,合理使用抗菌药物,是控制和减少多耐药性肺炎克雷伯杆菌感染的关键。     

浙江省麻疹病毒的基因特征分析

目的分析浙江省流行的麻疹病毒(MV)的基因特征,为更好地防控麻疹提供科学参考。方法从GenBank检索并下载浙江省所有麻疹病毒株、中国麻疹疫苗株和WHO推荐参考株的血凝素蛋白(H)和核蛋白(N)的基因组序列,利用MEGA 6.0软件进行比对分析,构建种系进化树,确定浙江省麻疹病毒流行的基因型别,并进行同源性和基因变异分析。结果浙江省麻疹病毒以H1基因型为主(27株),其他基因型为辅(2株B3型)。H1a亚型(21/27)占绝对优势,其次为H1b亚型(6/27)。浙江省所有毒株间H蛋白的氨基酸同源性为96.9%~100.0%,与疫苗株Shanghai-191和Changchun-47的同源性均为95.0%~96.0%。浙江省所有毒株间N蛋白羧基末端的氨基酸同源性为82.7%~100.0%,与疫苗株Shanghai-191的同源性为85.8%~89.5%,与疫苗株Changchun-47的同源性为87.3%~91.0%。结论麻疹病毒H1基因型为浙江省麻疹流行的优势株,与现行参考疫苗株(A基因型)差异较大,因此针对麻疹病毒H1基因型疫苗的研制是今后浙江省麻疹病毒防控的关键。     

2012‒2014年杭州市HBsAg、HCVAb、HIV及TP感染情况分析

摘要：目的 统计分析2012年～2014年浙江大学医学院附属第一医院就诊患者中HBsAg、HCV、HIV及TP感染情况，了解期间来院患者四种病原体的感染情况，为临床安全提供参考依据。方法 回顾性分析2012年～2014年我院住院患者血清中HBV、HCV、HIV和TP感染状况。结果 2012年至2014年共统计214 935人次，HBsAg阳性率为13.08%，HCV阳性率为0.51%，HIV阳性率为0.37%，TP阳性率为2.44%。各年份间HBsAg差异有统计学意义（HbsAg：χ2=55.74，P<0.0001；HCV：χ2=2.24，P=0.327；HIV：χ2=2.67，P=0.26；TP：χ2=2.65，P=0.27）。不同性别之间，HBsAg、HIV或TP阳性率差异有统计学意义（HBsAg：χ2=2680.6，P<0.0001；HCV：χ2=2.69，P=0.101；HIV：χ2=344.3，P<0.0001；TP：χ2=192.4，P<0.0001）；不同年龄段之间，HBsAg、HCV、HIV及TP阳性率差异有统计学意义（HbsAg：χ2=3036.1，P<0.0001；HCV：χ2=59.45，P<0.0001；HIV：χ2=246.06，P<0.0001；TP：χ2=636.80，P<0.0001）。结论 开展术前四项检测，有助于及时了解患者情况，明确人群感染情况，对制定感染的预防及治疗措施，避免院内感染的发生具有十分重要的意义。     

2013‒2015年浙江地区哨点医院H3N2甲型流感病毒 感染患者临床特点与流行病学特征

摘要：目的 分析2013?2015年浙江地区哨点医院监测纳入的H3N2甲型流感病毒感染患者的临床特点及流行病学特征。方法 对2013年1月至2015年12月浙江地区8家哨点医院纳入的符合急性呼吸道感染（acute respiratory infection,ARI）定义的病例进行流行病学和临床信息调查,采集呼吸道标本进行流感病毒核酸检测。按检测结果将病例分为H3N2阳性组和流感阴性组,分析两组病例流行病学和临床特征。结果 2013?2015年浙江地区8家哨点医院共纳入7 602例急性呼吸道感染,其中实验室确诊H3N2病例490例（占6.4%）。浙江地区连续3年的监测共出现3次发病高峰,分别是2013年12月?2014年3月、2015年1?3月和2015年7?8月。H3N2病例年龄中位数为50岁,其中男性占62%,慢性基础性疾病史、恶性肿瘤病史及吸烟史的患者在H3N2阳性组的比例高于流感阴性组,差异有统计学意义（其中慢性基础疾病史?2=6.600、7.519、3.875、53.719、3.997、31.086、63.789、21.309和53.95;恶性肿瘤史?2=55.316;吸烟史?2=14.418,P值均<0.05）。H3N2阳性组出现排痰性咳嗽、咯血、X线/CT表现异常和肺部听诊异常的比例较流感阴性组高,而H3N2阳性组白细胞总数和血小板总数较流感阴性组低,差异均有统计学意义（排痰性咳嗽?2=82.703,咯血?2=104.807,X线/CT表现异常?2=5.114,肺部听诊异常?2=11.823;白细胞总数t =?2.602、血小板总数t=?3.488,P值均<0.05）。结论 浙江地区H3N2流感多发生在冬春季和夏季,具有慢性基础疾病及肿瘤等病情的患者是感染的高危人群。