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1.
Few studies have examined the potential for pathogens with complex life cycles to cause selection on their required alternate (=intermediate) hosts. Here we examine the effects of two fungal pathogens on an herbaceous mustard, Arabis holboellii. One pathogen species uses A. holboellii as a primary host, the other uses it as an alternate host. This plant-pathogen system is especially interesting because the host, A. holboellii, is apomictic; thus individuals reproduce exact copies of themselves. Despite this mode of reproduction, A. holboellii populations are surprisingly genetically diverse. Could frequency dependent selection by pathogens be maintaining clonal diversity? This study assesses the potential for selection by pathogens. In a controlled greehouse experiment we show that there is heritable variation in A. holboellii's resistance to the rust, Puccinia monoica, and that host fitness is severely reduced by P. monoica infection in both the greenhouse and under natural conditions. Field observations indicate that host clones are also differentially susceptible to the short-cycled rust, P. thlaspeos, and that host fitness is reduced by infection to this pathogen as well. Although the preconditions for pathogen-mediated selection are present, frequency-dependent selection by pathogens is unlikely to be important in structuring populations of Arabis holboellii because multiple host genotypes are susceptible to the same inoculum and the pathogen has a long generation time. 相似文献
2.
Jose Vladimir Sandoval-Sierra María P. MartínJavier Diéguez-Uribeondo 《Fungal biology》2014,118(7):559-578
The lack of a robust taxonomy in the genus Saprolegnia is leading to the presence of incorrectly named isolates in culture collections and of an increasing number of misassigned sequences in DNA databases. Accurate species delimitation is critical for most biological disciplines. A recently proposed approach to solve species delimitation (taxonomic diagnosis system) of difficult organisms is the definition of molecular operational taxonomic units (MOTUs). We have used 961 sequences of nrDNA ITS from culture collections (461 sequences) and GenBank (500 sequences), to perform phylogenetic and clustering optimization analyses. As result, we have identified 29 DNA-based MOTUs in agreement with phylogenetic studies. The resulting molecular clusters support the validity of 18 species of Saprolegnia and identify 11 potential new ones. We have also listed a number of incorrectly named isolates in culture collections, misassigned species names to GenBank sequences, and reference sequences for the species. We conclude that GenBank represents the main source of errors for identifying Saprolegnia species since it possesses sequences with misassigned names and also sequencing errors. The presented taxonomic diagnosis system might help setting the basis for a suitable identification of species in this economically important genus. 相似文献
3.
目的:建立一种多重、快速、特异性好、灵敏度高的病原微生物检测方法。方法:根据GenBank数据库中的小肠结肠炎耶尔森氏菌、单核细胞增生性李斯特菌、产气荚膜梭菌、鼠疫耶尔森氏菌基因序列,分别针对ail、hly、cpe、3a基因设计4对引物和4条探针。通过重叠PCR扩增各目的基因并构建重组质粒,以该重组质粒DNA为模板,通过多重PCR同时扩增上述4个基因,建立xMAP液态芯片检测技术,在此基础上对标准菌株基因组DNA进行检测并验证该方法的特异性和敏感性。结果:xMAP液态芯片对质粒DNA和标准菌株基因组DNA的检测结果与多重PCR结果一致。该方法能在3.5 h内同时完成对4种病原菌的检测,特异性好,且敏感性要高于PCR方法,灵敏度最高可达200CFU/ml。结论:xMAP液态芯片技术是病原微生物的多重快速检测的新方法,具有很好的应用价值和前景。 相似文献
4.
应用xMAP液念芯片多重快速检测四种病原微生物的研究 总被引:3,自引:0,他引:3
目的:建立一种多重、快速、特异性好、灵敏度高的病原微生物检测方法。方法:根据GenBank数据库中的小肠结肠炎耶尔森氏菌、单核细胞增生性李斯特菌、产气荚膜梭菌、鼠疫耶尔森氏菌基因序列,分别针对ail、hly、cpe、3a基因设计4对引物和4条探针。通过重叠PCR扩增各目的基因并构建重组质粒,以该重组质粒DNA为模板,通过多重PCR同时扩增上述4个基因,建立xMAP液态芯片检测技术,在此基础上对标准菌株基因组DNA进行检测并验证该方法的特异性和敏感性。结果:xMAP液态芯片对质粒DNA和标准菌株基因组DNA的检测结果与多重PCR结果一致。该方法能在3.5 h内同时完成对4种病原菌的检测,特异性好,且敏感性要高于PCR方法,灵敏度最高可达200CFU/ml。结论:xMAP液态芯片技术是病原微生物的多重快速检测的新方法,具有很好的应用价值和前景。 相似文献
5.
目的 探讨老年糖尿病患者合并泌尿系感染病原菌的分布及其耐药性,为临床防治提供实验依据。方法 回顾性分析2011年1月至2014年12月桐乡市第三人民医院老年糖尿病患者合并泌尿系感染患者的尿液标本做病原学检测和药敏试验,并用WHONET 5.4软件对耐药数据进行统计分析。结果 共分离出病原菌267株,包括革兰阴性菌173株(64.79%),前四位为大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、奇异变形菌和阴沟肠杆菌;革兰阳性菌52株(19.48%),前三位为肠球菌属、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌;真菌42株(15.73%)。药敏结果显示,主要革兰阴性菌对阿米卡星、哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦和亚胺培南耐药率较低,主要革兰阳性菌对利福平、呋喃妥因、利奈唑胺、替考拉宁和万古霉素耐药率较低。结论 老年糖尿病患者易发生泌尿系感染 临床应结合药敏试验合理使用抗菌药物,减少耐药株的产生。 相似文献
6.
肺癌患者呼吸道病原菌感染的回顾性分析 总被引:2,自引:0,他引:2
目的:了解肺癌患者呼吸道感染的病原菌及其耐药特点,方法:对我院2000年1月-2002年1月肺癌患者痰标本所分离细菌进行回顾性分析。结果:肺癌病人呼吸道感染以G-菌为主占54.5%,其次是真菌21.9%及G 菌14.1%,G-菌中以沙雷菌属(32.2%),大肠埃希菌和铜绿假单胞菌(9.7%)为主,在大肠埃希菌中,产超广谱β-内酰胺酶株(ESBLS)占40.6%,真菌以白色假丝酵母菌(87.8%)为主,G 球菌中以凝固酶阴性葡萄球菌为主(76.9%),耐苯唑西林凝固酶阴性葡萄球菌(MRSCN)占63.6%,所分离细菌除对舒普生,特治星,亚胺培南及万古霉素耐药率较低外,常用抗生素显示较高的耐药率,结论:肺癌患者呼吸道感染的病原菌以G-菌为主,而真菌为G 菌亦不容忽视,且大多数病原菌耐药率较高,临床合理,规范使用抗生素是当务之急. 相似文献
7.
目的:探讨血液病患者的感染特点,为临床治疗提供病原学依据。方法:回顾性分析北京友谊医院2008年7月至2011年7月血液科住院患者临床分离出病原菌的情况。结果:原发病以血液系统恶性肿瘤为主。共培养出致病菌357株,包括革兰阴性杆菌(40.8%);革兰阳性球菌(24.1%);真菌(35.1%)。引起感染最常见的革兰阴性杆菌为铜绿假单胞菌,最常见的革兰阳性球菌为粪肠球菌,最常见的真菌为白色假丝酵母菌。革兰阴性杆菌来源为血29.4%,痰46.6%,尿10.3%;革兰阳性球菌来源为血14%,痰47.7%,尿10.4%;真菌来源为血8%,痰60.8%,尿4%。66.4%真菌感染患者中性粒细胞〈1.5×109/L。结论:血液病感染的致病菌以革兰阴性杆菌为主,呼吸道是主要感染部位。对于中性粒细胞减少的血液病感染患者,真菌感染的几率明显增加,经验性抗真菌治疗具有一定的意义。 相似文献
8.
目的:通过对某地区中心医院收集的临床血感染患者感染病原菌的分析,了解该地区血感染患者病原菌构成、分布及耐药特点,为临床治疗提供参考和指导。方法:收集2012年6月至2013年8月期间在某院就诊的858例血感染患者血液标本,采用BACTEC9050全自动血培养仪培养,采用VITEK 2 Compack系统和K-B琼脂纸片扩散法对阳性标本进行菌种鉴定和药敏检测。结果:血培养结果显示,在858份血培养标本中共检出阳性标本109份,每份标本都只检出一种病菌,总检出率为12.7%,革兰阳性菌占64.22%(70/109),革兰阴性菌占33.03%(36/109),真菌占0.35%%(3/109);药物敏感试验结果显示:葡萄球菌对青霉素、红霉素和复方新诺明耐药率40%;肠杆菌科细菌对氨苄西林和氯霉素耐药率40%;非发酵菌科细菌对氨苄西林,头孢他啶,头孢噻肟和氯霉素耐药率40%。结论:目前本地区临床血感染患者革兰阳性菌感染率高,以金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性葡萄球菌为主,治疗可以首选糖肽类抗菌药物;革兰阴性菌以大肠杆菌和绿脓杆菌为主,对氨苄西林、氯霉素耐药率高,大肠杆菌对头孢类抗生素的耐受较绿脓杆菌低,两种细菌感染治疗可以考虑选择单环-内酰胺类抗生素。及时准确的血培养结果及药敏试验可为临床合理选择抗菌药物提供重要依据。 相似文献
9.
青海豌豆根腐病病原菌种类及致病性的研究 总被引:4,自引:0,他引:4
豌豆极腐病是青海东部干旱地区豌豆生产上的一种新病害,近年来危害逐年加重,致使豌豆产量遭受严重损失。根据分离鉴定和致病性测定结果,青海豌豆根腐病病原真菌是由茄镰刀菌、尖孢镰刀菌、豌豆丝囊霉、根串珠霉、立枯丝核菌、腐霉、链孢粘帚霉等复合反染所引起的。经回接试验:镰刀菌和豌豆丝囊霉对豌豆具有较强的致病力;腐霉及其他病原菌则有加强腐烂作用。 相似文献
10.
目的了解泌尿系统感染的病原菌分布及药物耐药性。方法采用法国生物梅里埃公司的VITEK60分析仪对2008年至2010年宁波市妇女儿童医院疑为泌尿系统感染患者的尿液标本进行细菌培养、菌株鉴定,纸片扩散确证试验检测ESBLs。结果 2008年至2010年尿标本中共分离出病原菌1 561株,以大肠埃希菌最多见,占27.2%,其次肺炎克雷伯菌、奇异变形菌、粪肠球菌(D群),各占6.34%、6.28%和6.21%,再次是表皮葡萄球、白色念珠菌和屎肠球菌(D群),各占4.48%、4.36%和3.91%。表皮葡萄球、粪肠球菌(D群)、屎肠球菌(D群)对万古霉素均敏感,对利奈唑烷仅1株粪肠球菌(D群)耐药。3年中,无1例大肠埃希菌对亚胺培南耐药,1株肺炎克雷伯菌和1株奇异变形菌对亚胺培南耐药,其他药物均有不同程度耐药。结论大肠埃希菌是导致泌尿系统感染最常见的致病菌,产ESBLs的菌株已达46.6%。治疗由产ESBLs细菌引起的尿路感染首选亚胺培南和哌拉西林/他唑巴坦;引起尿路感染的革兰阳性菌主要为肠球菌,青霉素可作为治疗粪肠球菌引起的尿路感染,但不适合治疗屎肠球菌引起的尿路感染,耐药率已达95%以上,呋喃妥因、利奈坐烷、万古霉素可作为首选。 相似文献